This table shows the complete data from the mutations.tsv file exactly as it appears in the source. Scroll horizontally to see all columns.
Unnamed: 0 | Unnamed: 1 | Unnamed: 2 | Unnamed: 3 | SRR24054552 | Unnamed: 5 | SRR24054553 | Unnamed: 7 | SRR24054578 | Unnamed: 9 | SRR24054762 | Unnamed: 11 | SRR24054763 | Unnamed: 13 | SRR24054764 | Unnamed: 15 | SRR24054765 | Unnamed: 17 | SRR24054766 | Unnamed: 19 | SRR24054767 | Unnamed: 21 | SRR24054768 | Unnamed: 23 | SRR24054800 | Unnamed: 25 | SRR24054801 | Unnamed: 27 | SRR24057621 | Unnamed: 29 | SRR24057729 | Unnamed: 31 | SRR24057734 | Unnamed: 33 | SRR24057739 | Unnamed: 35 | SRR24057740 | Unnamed: 37 | SRR24057743 | Unnamed: 39 | SRR24057765 | Unnamed: 41 | SRR24057766 | Unnamed: 43 | SRR24062986 | Unnamed: 45 | SRR24062988 | Unnamed: 47 | SRR24062989 | Unnamed: 49 | SRR24063095 | Unnamed: 51 | SRR24093731 | Unnamed: 53 | SRR24148596 | Unnamed: 55 | SRR24234178 | Unnamed: 57 | SRR24234179 | Unnamed: 59 | SRR24234189 | Unnamed: 61 | SRR24335619 | Unnamed: 63 | SRR24529533 | Unnamed: 65 | SRR24900557 | Unnamed: 67 | SRR24900558 | Unnamed: 69 | SRR24900559 | Unnamed: 71 | SRR24938797 | Unnamed: 73 | SRR25109028 | Unnamed: 75 | SRR25109029 | Unnamed: 77 | SRR25109039 | Unnamed: 79 | SRR24054146 | Unnamed: 81 | SRR24054248 | Unnamed: 83 | SRR24054251 | Unnamed: 85 | SRR24054268 | Unnamed: 87 | SRR24054269 | Unnamed: 89 | SRR24054385 | Unnamed: 91 | SRR24054513 | Unnamed: 93 | SRR24054548 | Unnamed: 95 | SRR24054595 | Unnamed: 97 | SRR24054632 | Unnamed: 99 | SRR24054634 | Unnamed: 101 | SRR24054699 | Unnamed: 103 | SRR24056917 | Unnamed: 105 | SRR24056985 | Unnamed: 107 | SRR24057384 | Unnamed: 109 | SRR24057509 | Unnamed: 111 | SRR24057546 | Unnamed: 113 | SRR24057549 | Unnamed: 115 | SRR24057669 | Unnamed: 117 | SRR24057769 | Unnamed: 119 | SRR24062929 | Unnamed: 121 | SRR24063005 | Unnamed: 123 | SRR24063177 | Unnamed: 125 | SRR24063178 | Unnamed: 127 | SRR24093818 | Unnamed: 129 | SRR24093828 | Unnamed: 131 | SRR24234150 | Unnamed: 133 | SRR24234171 | Unnamed: 135 | SRR24234210 | Unnamed: 137 | SRR24335707 | Unnamed: 139 | SRR24335711 | Unnamed: 141 | SRR24900551 | Unnamed: 143 | SRR24900664 | Unnamed: 145 | SRR24900685 | Unnamed: 147 | SRR24938814 | Unnamed: 149 | SRR25109062 | Unnamed: 151 | SRR25109074 | Unnamed: 153 | SRR25109077 | Unnamed: 155 | Unnamed: 156 | Unnamed: 157 | Unnamed: 158 | Unnamed: 159 | Unnamed: 160 | Key | Unnamed: 162 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
('2022-10-16', '654817') | ('2022-10-09', '654817') | ('2022-07-31', '14000') | ('2022-09-25', '654817') | ('2022-09-18', '654817') | ('2022-09-11', '654817') | ('2022-09-06', '654817') | ('2022-08-28', '654817') | ('2022-08-14', '654817') | ('2022-08-07', '654817') | ('2022-09-11', '14000') | ('2022-09-06', '14000') | ('2023-02-12', '645940') | ('2022-11-27', '654817') | ('2023-02-05', '654817') | ('2023-01-03', '654817') | ('2022-12-27', '645940') | ('2022-12-04', '645940') | ('2022-11-13', '14000') | ('2022-11-06', '14000') | ('2023-03-12', '654817') | ('2023-03-05', '654817') | ('2023-02-26', '654817') | ('2023-03-12', '14000') | ('2023-03-19', '654817') | ('2023-03-26', '14000') | ('2022-08-21', '654817') | ('2023-04-02', '654817') | ('2023-04-02', '14000') | ('2023-04-16', '14000') | ('2023-04-09', '654817') | ('2023-05-21', '14000') | ('2023-05-14', '14000') | ('2023-05-07', '14000') | ('2023-05-30', '14000') | ('2023-06-11', '654817') | ('2023-06-04', '654817') | ('2023-06-04', '14000') | ('2022-09-06', '372208') | ('2022-10-09', '566136') | ('2022-09-18', '566136') | ('2022-08-07', '125247') | ('2022-07-31', '125247') | ('2022-08-14', '200666') | ('2022-09-06', '65469') | ('2022-08-28', '195577') | ('2022-09-11', '524154') | ('2022-09-25', '103379') | ('2022-09-11', '103379') | ('2022-10-16', '200666') | ('2023-02-05', '372208') | ('2022-11-27', '200666') | ('2022-11-07', '226729') | ('2023-02-12', '68874') | ('2022-12-04', '566136') | ('2022-11-13', '566136') | ('2023-01-03', '313158') | ('2022-12-27', '524154') | ('2023-03-12', '313158') | ('2023-03-12', '103379') | ('2023-03-05', '524154') | ('2023-02-26', '195577') | ('2023-03-19', '566136') | ('2023-03-20', '88710') | ('2022-08-21', '103379') | ('2023-04-02', '566136') | ('2023-04-02', '372208') | ('2023-04-16', '200666') | ('2023-04-09', '125247') | ('2023-05-07', '45000') | ('2023-05-14', '54500') | ('2023-05-21', '566136') | ('2023-05-30', '372208') | ('2023-06-11', '85000') | ('2023-06-04', '195577') | ('2023-06-04', '372208') | Cryptic Sewershed | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Linked/Ubiquitous | Position | Flagged | Sequences | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Count | Abundance | Total samples | Positives Sum | Negatives Sum | Total Sum | Non-Cryptic Sewershed | ||
78 | T78A | 123 | 0.048 | 274 | 0.301 | 722 | 0.328 | 1014 | 0.436 | 62 | 0.47 | 2391 | 0.423 | 1662 | 0.506 | 1478 | 0.215 | 862 | 0.506 | 9 | 3.233 | 0 | 3.233 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178 | A178G | 98 | 1 | 650 | 0.998 | 133 | 0.14 | 64 | 0.024 | 121 | 0.617 | 259 | 0.427 | 2945 | 0.692 | 294 | 0.309 | 1705 | 0.564 | 212 | 0.188 | 1634 | 0.516 | 215 | 1 | 6581 | 0.846 | 3977 | 0.809 | 5811 | 0.716 | 187 | 1 | 968 | 0.523 | 17 | 10.369 | 0 | 10.369 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
329 | C329A|(ORF1ab_polyprotein:C64A(Q22K))|(ORF1a_polyprotein:C64A(Q22K)) | 385 | 0.049 | 476 | 0.323 | 1627 | 0.377 | 2533 | 0.544 | 123 | 0.609 | 6690 | 0.522 | 5540 | 0.696 | 3274 | 0.254 | 1480 | 0.53 | 9 | 3.904 | 0 | 3.904 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
344 | C344T|(ORF1ab_polyprotein:C79T(L27F))|(ORF1a_polyprotein:C79T(L27F)) | 412 | 0.225 | 35 | 0.036 | 2 | 0.001 | 155 | 0.059 | 276 | 0.058 | 73 | 0.063 | 2 | 0.001 | 4273 | 0.226 | 14 | 0.006 | 423 | 0.319 | 54 | 0.026 | 1297 | 0.32 | 174 | 0.572 | 4748 | 0.336 | 3555 | 0.298 | 3321 | 0.25 | 19 | 0.007 | 1404 | 0.527 | 18 | 3.33 | 0 | 3.33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
378 | RATG13 | T378C|(ORF1ab_polyprotein:GTC112-114GCT(V38A))|(ORF1a_polyprotein:GTC112-114GCT(V38A)) | 840 | 0.159 | 222 | 0.056 | 1519 | 0.205 | 1291 | 0.423 | 12406 | 0.416 | 57 | 0.024 | 1035 | 0.141 | 515 | 0.105 | 3592 | 0.544 | 93 | 0.033 | 80 | 0.07 | 705 | 0.172 | 24247 | 0.731 | 639 | 0.078 | 308 | 0.319 | 6108 | 0.237 | 11388 | 0.611 | 42 | 1 | 4252 | 0.392 | 37 | 0.127 | 7684 | 0.96 | 1495 | 0.474 | 273 | 0.659 | 15722 | 0.892 | 12913 | 0.801 | 11746 | 0.913 | 5976 | 0.997 | 133 | 1 | 1058 | 0.515 | 29 | 13.054 | 0 | 13.054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
378 | RATG13 | T378C|(ORF1ab_polyprotein:T113C(V38A))|(ORF1a_polyprotein:T113C(V38A)) | 46 | 0.009 | 7599 | 0.255 | 447 | 0.185 | 1245 | 0.253 | 647 | 0.098 | 5 | 0.002 | 182 | 0.044 | 1248 | 0.038 | 3072 | 0.165 | 4593 | 0.969 | 626 | 0.199 | 141 | 0.341 | 1606 | 0.091 | 3142 | 0.195 | 1087 | 0.084 | 996 | 0.484 | 16 | 3.412 | 0 | 3.412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
379 | RATG13 | C379T|(ORF1ab_polyprotein:GTC112-114GCT(V38A))|(ORF1a_polyprotein:GTC112-114GCT(V38A)) | 840 | 0.158 | 222 | 0.055 | 1519 | 0.204 | 1291 | 0.422 | 12406 | 0.353 | 57 | 0.023 | 1035 | 0.14 | 515 | 0.098 | 3592 | 0.512 | 93 | 0.033 | 80 | 0.069 | 705 | 0.17 | 24247 | 0.718 | 639 | 0.078 | 308 | 0.319 | 6108 | 0.236 | 11388 | 0.571 | 42 | 1 | 4252 | 0.39 | 37 | 0.126 | 7684 | 0.96 | 1495 | 0.474 | 273 | 0.655 | 15722 | 0.885 | 12913 | 0.719 | 11746 | 0.912 | 5976 | 0.997 | 133 | 1 | 1058 | 0.514 | 29 | 12.791 | 0 | 12.791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
754 | T754A|(ORF1ab_polyprotein:T489A(T163T))|(ORF1a_polyprotein:T489A(T163T)) | 439 | 0.995 | 1684 | 0.134 | 2069 | 0.349 | 1796 | 0.228 | 1475 | 0.537 | 1621 | 0.166 | 1953 | 0.322 | 4037 | 0.441 | 789 | 0.189 | 1611 | 0.311 | 6963 | 0.585 | 5 | 0.004 | 10454 | 0.543 | 569 | 0.465 | 1203 | 0.198 | 2491 | 0.589 | 9612 | 0.998 | 5306 | 0.949 | 7512 | 0.994 | 3764 | 0.998 | 7642 | 0.996 | 5 | 0.001 | 3 | 0.001 | 23 | 10.991 | 0.002 | 10.993 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
934 | C934T|(ORF1ab_polyprotein:C669T(D223D))|(ORF1a_polyprotein:C669T(D223D)) | 436 | 0.219 | 640 | 0.997 | 9607 | 0.682 | 6556 | 0.998 | 3561 | 0.478 | 1603 | 0.544 | 2624 | 0.305 | 1787 | 0.293 | 8078 | 0.901 | 847 | 0.186 | 1316 | 0.262 | 7127 | 0.618 | 11074 | 0.556 | 635 | 0.451 | 1203 | 0.178 | 2804 | 0.611 | 12402 | 0.996 | 7482 | 0.996 | 9321 | 0.996 | 4588 | 0.997 | 9253 | 0.998 | 21 | 13.262 | 0 | 13.262 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1009 | C1009T|(ORF1ab_polyprotein:C744T(S248S))|(ORF1a_polyprotein:C744T(S248S)) | 1465 | 0.068 | 598 | 0.049 | 935 | 0.073 | 1431 | 0.105 | 316 | 0.023 | 6106 | 0.441 | 2618 | 0.896 | 5089 | 0.812 | 1218 | 0.274 | 4699 | 0.305 | 2823 | 0.315 | 1192 | 0.284 | 7628 | 0.848 | 13 | 4.493 | 0 | 4.493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1231 | G1231A|(ORF1ab_polyprotein:G966A(K322K))|(ORF1a_polyprotein:G966A(K322K)) | 6084 | 0.631 | 4781 | 0.4 | 906 | 0.416 | 7440 | 0.447 | 761 | 0.193 | 784 | 0.115 | 1301 | 0.182 | 1014 | 0.311 | 3735 | 0.503 | 1249 | 0.173 | 1047 | 0.129 | 325 | 0.453 | 3816 | 0.995 | 98 | 0.28 | 2455 | 0.657 | 1622 | 0.217 | 1242 | 0.248 | 298 | 0.475 | 18 | 6.825 | 0 | 6.825 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1264 | G1264T|(ORF1ab_polyprotein:G999T(T333T))|(ORF1a_polyprotein:G999T(T333T)) | 3007 | 0.183 | 1362 | 0.478 | 10324 | 0.493 | 1067 | 0.2 | 406 | 0.048 | 1368 | 0.324 | 4611 | 0.46 | 1609 | 0.19 | 2980 | 0.496 | 1925 | 0.682 | 5139 | 0.998 | 160 | 0.358 | 4602 | 0.998 | 1594 | 0.33 | 3986 | 0.401 | 1638 | 0.295 | 540 | 0.644 | 3 | 0.001 | 9 | 0.001 | 19 | 7.578 | 0.002 | 7.58 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1592 | T1592A|(ORF1ab_polyprotein:T1327A(S443T))|(ORF1a_polyprotein:T1327A(S443T)) | 2528 | 0.398 | 8079 | 0.59 | 10241 | 0.449 | 2559 | 0.28 | 34163 | 0.999 | 5450 | 0.454 | 182 | 0.493 | 10192 | 0.525 | 11184 | 0.303 | 1382 | 0.091 | 19942 | 0.841 | 89 | 0.026 | 13 | 0.004 | 1371 | 0.446 | 5179 | 0.43 | 538 | 0.657 | 3176 | 0.475 | 789 | 0.954 | 8225 | 0.995 | 196 | 0.164 | 9458 | 0.659 | 2571 | 0.998 | 11062 | 0.998 | 10429 | 0.977 | 718 | 1 | 76 | 1 | 10341 | 0.999 | 2 | 0.002 | 3 | 0.001 | 29 | 16.205 | 0.003 | 16.208 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2043 | A2043C|(ORF1ab_polyprotein:A1778C(N593T))|(ORF1a_polyprotein:A1778C(N593T)) | 11 | 0.001 | 18 | 0.001 | 27 | 0.002 | 8 | 0.002 | 39 | 0.001 | 6610 | 0.998 | 8210 | 0.999 | 36 | 0.003 | 5 | 0.002 | 12 | 0.001 | 32 | 0.001 | 576 | 0.039 | 21 | 0.001 | 8928 | 0.999 | 24 | 0.001 | 83 | 0.006 | 30 | 0.001 | 4 | 0.001 | 18 | 0.003 | 56 | 0.001 | 20 | 3.05 | 0.013 | 3.06299999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2706 | C2706T|(ORF1ab_polyprotein:C2441T(T814I))|(ORF1a_polyprotein:C2441T(T814I)) | 1745 | 0.407 | 2622 | 0.811 | 2175 | 0.576 | 320 | 0.982 | 7 | 0.002 | 2 | 0.002 | 6 | 2.776 | 0.004 | 2.78 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3220 | A3220G|(ORF1ab_polyprotein:A2955G(Q985Q))|(ORF1a_polyprotein:A2955G(Q985Q)) | 1481 | 0.43 | 208 | 1 | 1265 | 0.998 | 3719 | 0.803 | 881 | 0.354 | 188 | 0.245 | 646 | 1 | 319 | 0.149 | 1027 | 0.315 | 2339 | 0.915 | 518 | 0.52 | 277 | 0.169 | 773 | 0.62 | 1522 | 0.31 | 5473 | 0.674 | 238 | 0.122 | 1531 | 0.54 | 5866 | 0.996 | 2435 | 0.998 | 1386 | 1 | 1707 | 0.999 | 2011 | 0.996 | 11610 | 0.998 | 4973 | 0.999 | 6071 | 0.996 | 3688 | 0.996 | 6820 | 0.999 | 2 | 0.002 | 2 | 0.001 | 29 | 19.141 | 0.003 | 19.144 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3333 | TTG3333-3335del|(ORF1ab_polyprotein:ATTGAA3067-3072AAAdel(IE1023-1024Kdel))|(ORF1a_polyprotein:ATTGAA3067-3072AAAdel(IE1023-1024Kdel)) | 1501 | 0.36 | 269 | 1 | 1414 | 0.997 | 3970 | 0.684 | 872 | 0.288 | 233 | 0.233 | 975 | 0.998 | 329 | 0.117 | 971 | 0.238 | 2582 | 0.79 | 654 | 0.512 | 236 | 0.135 | 895 | 0.563 | 1325 | 0.242 | 5001 | 0.589 | 220 | 0.1 | 1285 | 0.427 | 6079 | 0.997 | 2371 | 0.997 | 1389 | 0.998 | 1870 | 0.998 | 1973 | 0.997 | 10850 | 0.997 | 5152 | 0.998 | 5684 | 0.998 | 3663 | 0.998 | 6490 | 0.998 | 27 | 18.249 | 0 | 18.249 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3495 | A3495C|(ORF1ab_polyprotein:A3230C(K1077T))|(ORF1a_polyprotein:A3230C(K1077T)) | 1062 | 0.326 | 2521 | 0.999 | 5433 | 0.999 | 2449 | 0.363 | 4452 | 0.469 | 11266 | 0.932 | 1581 | 0.478 | 1940 | 0.243 | 332 | 0.468 | 8198 | 0.998 | 957 | 0.337 | 5932 | 0.997 | 554 | 0.496 | 3966 | 0.998 | 795 | 0.999 | 8749 | 0.885 | 6526 | 0.95 | 478 | 0.996 | 10836 | 0.997 | 19 | 13.93 | 0 | 13.93 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3542 | A3542G|(ORF1ab_polyprotein:A3277G(T1093A))|(ORF1a_polyprotein:A3277G(T1093A)) | 945 | 0.319 | 2308 | 0.997 | 5185 | 0.999 | 2132 | 0.356 | 3734 | 0.398 | 10209 | 0.952 | 1387 | 0.462 | 1787 | 0.228 | 323 | 0.407 | 7594 | 0.997 | 855 | 0.325 | 5684 | 0.998 | 478 | 0.443 | 3586 | 0.998 | 823 | 1 | 7721 | 0.874 | 6233 | 0.943 | 432 | 0.993 | 9185 | 0.999 | 19 | 13.688 | 0 | 13.688 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3558 | A3558C|(ORF1ab_polyprotein:A3293C(K1098T))|(ORF1a_polyprotein:A3293C(K1098T)) | 2197 | 0.999 | 2606 | 0.318 | 6141 | 0.389 | 11062 | 0.687 | 1756 | 0.489 | 2715 | 0.286 | 10 | 0.001 | 457 | 0.472 | 11 | 0.001 | 7070 | 0.68 | 1047 | 0.379 | 5615 | 0.997 | 565 | 0.463 | 3602 | 0.998 | 8525 | 0.854 | 7916 | 0.743 | 428 | 0.993 | 9545 | 0.999 | 4 | 0.003 | 13 | 0.002 | 20 | 10.748 | 0.005 | 10.753 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3938 | A3938G|(ORF1ab_polyprotein:A3673G(R1225G))|(ORF1a_polyprotein:A3673G(R1225G)) | 88 | 0.232 | 178 | 0.461 | 229 | 1 | 67 | 1 | 28 | 1 | 916 | 0.676 | 89 | 0.517 | 13525 | 0.931 | 3 | 0.001 | 9 | 5.817 | 0.001 | 5.818 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4267 | A4267G|(ORF1ab_polyprotein:A4002G(L1334L))|(ORF1a_polyprotein:A4002G(L1334L)) | 2446 | 0.746 | 42 | 1 | 817 | 0.465 | 48 | 0.364 | 82 | 0.796 | 215 | 1 | 65 | 0.225 | 56 | 0.179 | 849 | 0.915 | 638 | 0.326 | 20 | 1 | 1207 | 1 | 916 | 0.998 | 1679 | 0.999 | 992 | 0.996 | 2177 | 0.998 | 1493 | 0.899 | 4 | 1 | 3792 | 0.999 | 19 | 14.905 | 0 | 14.905 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4346 | T4346C|(ORF1ab_polyprotein:T4081C(S1361P))|(ORF1a_polyprotein:T4081C(S1361P)) | 806 | 0.917 | 1431 | 0.765 | 607 | 0.739 | 1823 | 0.776 | 1307 | 0.983 | 23 | 0.821 | 78 | 1 | 2983 | 0.859 | 3467 | 0.96 | 6909 | 0.998 | 12 | 0.031 | 519 | 0.471 | 1029 | 0.618 | 16 | 1 | 1441 | 1 | 2840 | 0.835 | 3791 | 0.994 | 467 | 0.994 | 729 | 0.997 | 711 | 0.535 | 371 | 0.997 | 246 | 0.996 | 867 | 0.997 | 6916 | 0.991 | 2922 | 0.997 | 312 | 1 | 1352 | 0.999 | 27 | 23.27 | 0 | 23.27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4473 | A4473G|(ORF1ab_polyprotein:A4208G(Q1403R))|(ORF1a_polyprotein:A4208G(Q1403R)) | 3 | 0.002 | 183 | 0.232 | 1078 | 1 | 979 | 0.343 | 901 | 0.202 | 730 | 0.997 | 965 | 0.999 | 852 | 0.998 | 4489 | 0.834 | 1546 | 0.542 | 302 | 0.918 | 11 | 7.067 | 0 | 7.067 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4771 | T4771A|(ORF1ab_polyprotein:T4506A(I1502I))|(ORF1a_polyprotein:T4506A(I1502I)) | 2531 | 0.209 | 3089 | 0.25 | 1521 | 0.998 | 3200 | 0.872 | 4174 | 0.746 | 215 | 0.43 | 29 | 0.001 | 7 | 3.505 | 0.001 | 3.506 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4971 | A4971G|(ORF1ab_polyprotein:A4706G(K1569R))|(ORF1a_polyprotein:A4706G(K1569R)) | 2925 | 0.517 | 2694 | 0.434 | 3709 | 0.311 | 3879 | 1 | 4216 | 0.349 | 5273 | 0.715 | 4494 | 0.459 | 2054 | 0.189 | 7043 | 0.47 | 3489 | 0.339 | 17814 | 0.796 | 3279 | 0.224 | 2220 | 0.168 | 289 | 0.474 | 3727 | 0.243 | 3384 | 0.997 | 70 | 0.059 | 273 | 0.313 | 1526 | 0.234 | 668 | 0.993 | 10610 | 0.962 | 6710 | 0.8 | 706 | 0.891 | 4 | 0.001 | 24 | 11.938 | 0 | 11.938 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4980 | C4980A|(ORF1ab_polyprotein:C4715A(T1572K))|(ORF1a_polyprotein:C4715A(T1572K)) | 428 | 0.334 | 775 | 0.077 | 1620 | 0.208 | 2484 | 0.132 | 619 | 0.086 | 4871 | 0.438 | 4235 | 0.395 | 3399 | 0.996 | 3904 | 0.331 | 44 | 0.045 | 473 | 0.062 | 1437 | 0.192 | 67 | 0.083 | 2 | 0.001 | 3 | 0.004 | 15 | 3.379 | 0.005 | 3.384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5016 | T5016C|(ORF1ab_polyprotein:T4751C(V1584A))|(ORF1a_polyprotein:T4751C(V1584A)) | 1836 | 0.472 | 161 | 0.722 | 2471 | 0.499 | 1025 | 0.997 | 10055 | 0.937 | 3646 | 0.819 | 506 | 0.828 | 7 | 0.006 | 8 | 5.274 | 0.006 | 5.28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5104 | T5104C|(ORF1ab_polyprotein:T4839C(H1613H))|(ORF1a_polyprotein:T4839C(H1613H)) | 375 | 0.989 | 345 | 1 | 1350 | 0.762 | 1238 | 0.998 | 1835 | 0.574 | 1461 | 0.623 | 1225 | 0.39 | 3767 | 0.974 | 343 | 0.123 | 511 | 0.455 | 1832 | 0.778 | 3163 | 0.998 | 967 | 0.457 | 2185 | 0.996 | 134 | 1 | 355 | 0.221 | 109 | 0.507 | 1364 | 0.445 | 643 | 1 | 5721 | 0.997 | 2053 | 0.961 | 339 | 0.997 | 9 | 0.001 | 23 | 16.245 | 0.001 | 16.246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5105 | G5105A|(ORF1ab_polyprotein:G4840A(E1614K))|(ORF1a_polyprotein:G4840A(E1614K)) | 376 | 0.992 | 344 | 0.997 | 1354 | 0.764 | 1239 | 0.999 | 1840 | 0.576 | 1462 | 0.623 | 1225 | 0.391 | 3764 | 0.973 | 344 | 0.124 | 510 | 0.455 | 1837 | 0.78 | 3166 | 0.999 | 965 | 0.456 | 2189 | 0.998 | 134 | 1 | 355 | 0.221 | 109 | 0.507 | 1361 | 0.444 | 642 | 0.998 | 5729 | 0.999 | 2130 | 0.998 | 340 | 1 | 22 | 16.294 | 0 | 16.294 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5618 | A5618G|(ORF1ab_polyprotein:A5353G(I1785V))|(ORF1a_polyprotein:A5353G(I1785V)) | 3074 | 0.178 | 3228 | 0.18 | 3258 | 0.998 | 4164 | 0.619 | 5919 | 0.964 | 14115 | 0.895 | 9953 | 0.778 | 6229 | 0.739 | 8 | 5.351 | 0 | 5.351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5648 | RATG13 | A5648C|(ORF1ab_polyprotein:A5383C(K1795Q))|(ORF1a_polyprotein:A5383C(K1795Q)) | 8999 | 0.634 | 6052 | 0.798 | 10063 | 0.624 | 10732 | 0.84 | 4658 | 0.967 | 8548 | 0.452 | 4640 | 0.402 | 4112 | 0.19 | 15120 | 0.605 | 17822 | 0.617 | 31329 | 0.977 | 2136 | 0.217 | 5244 | 0.446 | 7878 | 0.682 | 8015 | 0.163 | 2512 | 0.354 | 4 | 0.001 | 10782 | 0.424 | 1358 | 0.996 | 971 | 0.437 | 6169 | 0.666 | 7349 | 0.998 | 19254 | 0.997 | 11894 | 0.997 | 10578 | 0.998 | 25 | 15.482 | 0 | 15.482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6069 | T6069C|(ORF1ab_polyprotein:T5804C(I1935T))|(ORF1a_polyprotein:T5804C(I1935T)) | 520 | 0.389 | 1318 | 0.55 | 246 | 0.363 | 1754 | 0.987 | 613 | 0.732 | 925 | 0.417 | 661 | 0.32 | 142 | 0.251 | 2324 | 0.816 | 441 | 0.227 | 38 | 0.013 | 39 | 0.205 | 1099 | 0.983 | 75 | 0.714 | 2161 | 0.984 | 95 | 1 | 758 | 0.977 | 2039 | 0.98 | 1212 | 0.868 | 34 | 0.694 | 3 | 0.002 | 21 | 12.47 | 0.002 | 12.472 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6285 | C6285T|(ORF1ab_polyprotein:C6020T(T2007I))|(ORF1a_polyprotein:C6020T(T2007I)) | 16 | 0.727 | 2 | 0.333 | 37 | 1 | 12 | 0.25 | 22 | 0.917 | 18 | 0.5 | 102 | 0.962 | 87 | 0.572 | 13 | 0.217 | 25 | 0.272 | 16 | 0.188 | 2 | 0.667 | 4 | 1 | 8 | 1 | 8 | 1 | 4 | 1 | 39 | 0.929 | 26 | 0.963 | 2 | 1 | 9 | 1 | 16 | 1 | 8 | 0.16 | 22 | 15.497 | 0.16 | 15.657 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6573 | CTA6573-6575del|(ORF1ab_polyprotein:TCTAGT6307-6312TGTdel(SS2103-2104Cdel))|(ORF1a_polyprotein:TCTAGT6307-6312TGTdel(SS2103-2104Cdel)) | 7 | 0.7 | 46 | 0.836 | 4 | 0.571 | 6 | 0.4 | 50 | 0.893 | 17 | 0.447 | 111 | 0.665 | 9 | 0.148 | 8 | 4.66 | 0 | 4.66 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6842 | T6842A|(ORF1ab_polyprotein:TCT6577-6579AAT(S2193N))|(ORF1a_polyprotein:TCT6577-6579AAT(S2193N)) | 4 | 0.059 | 72 | 0.148 | 367 | 0.997 | 141 | 0.332 | 1682 | 0.391 | 2 | 0.035 | 334 | 0.267 | 188 | 0.241 | 1605 | 0.356 | 2783 | 0.862 | 64 | 0.235 | 229 | 0.218 | 68 | 0.155 | 6 | 0.017 | 4779 | 0.997 | 697 | 0.996 | 89 | 0.394 | 3 | 0.375 | 465 | 0.991 | 4 | 0.002 | 2 | 1 | 6481 | 0.996 | 2425 | 0.811 | 618 | 0.994 | 3801 | 0.998 | 25 | 12.867 | 0 | 12.867 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6843 | C6843A|(ORF1ab_polyprotein:TCT6577-6579AAT(S2193N))|(ORF1a_polyprotein:TCT6577-6579AAT(S2193N)) | 4 | 0.059 | 72 | 0.148 | 367 | 0.997 | 141 | 0.332 | 1682 | 0.391 | 2 | 0.035 | 334 | 0.267 | 188 | 0.24 | 1605 | 0.356 | 2783 | 0.862 | 64 | 0.235 | 229 | 0.218 | 68 | 0.154 | 6 | 0.017 | 4779 | 0.997 | 697 | 0.996 | 89 | 0.394 | 3 | 0.375 | 465 | 0.991 | 4 | 0.002 | 2 | 1 | 6481 | 0.996 | 2425 | 0.811 | 618 | 0.994 | 3801 | 0.998 | 25 | 12.865 | 0 | 12.865 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6884 | G6884T|(ORF1ab_polyprotein:G6619T(G2207C))|(ORF1a_polyprotein:G6619T(G2207C)) | 58 | 0.164 | 367 | 1 | 148 | 0.423 | 2103 | 0.508 | 403 | 0.366 | 241 | 0.337 | 2020 | 0.464 | 2481 | 0.907 | 64 | 0.227 | 311 | 0.286 | 101 | 0.212 | 2 | 0.001 | 1327 | 0.28 | 638 | 0.998 | 111 | 0.569 | 1090 | 0.175 | 686 | 0.198 | 203 | 0.342 | 18 | 7.457 | 0 | 7.457 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6894 | G6894T|(ORF1ab_polyprotein:G6629T(C2210F))|(ORF1a_polyprotein:G6629T(C2210F)) | 2 | 0.001 | 3 | 0.002 | 3214 | 0.704 | 477 | 0.994 | 4713 | 0.812 | 2394 | 0.703 | 356 | 0.638 | 2996 | 0.997 | 6 | 0.002 | 7 | 0.001 | 3 | 0.004 | 10 | 0.001 | 12 | 4.851 | 0.008 | 4.859 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6939 | A6939G|(ORF1ab_polyprotein:A6674G(K2225R))|(ORF1a_polyprotein:A6674G(K2225R)) | 2 | 0.002 | 2511 | 0.691 | 380 | 0.99 | 4029 | 0.807 | 1957 | 0.687 | 334 | 0.64 | 2789 | 0.991 | 7 | 4.808 | 0 | 4.808 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7389 | C7389T|(ORF1ab_polyprotein:C7124T(A2375V))|(ORF1a_polyprotein:C7124T(A2375V)) | 199 | 0.357 | 1209 | 0.571 | 886 | 0.37 | 524 | 0.38 | 155 | 0.18 | 314 | 0.136 | 77 | 0.032 | 934 | 0.584 | 2152 | 0.906 | 4 | 0.002 | 459 | 0.361 | 1698 | 0.429 | 54 | 0.216 | 20 | 0.333 | 632 | 0.912 | 18 | 0.17 | 1878 | 0.998 | 460 | 0.639 | 523 | 0.992 | 1638 | 0.987 | 840 | 0.979 | 2 | 1 | 1879 | 0.959 | 4 | 0.002 | 24 | 12.493 | 0.002 | 12.495 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7428 | C7428T|(ORF1ab_polyprotein:C7163T(A2388V))|(ORF1a_polyprotein:C7163T(A2388V)) | 95 | 0.106 | 687 | 0.312 | 3 | 0.009 | 856 | 0.454 | 439 | 0.068 | 102 | 0.179 | 201 | 0.03 | 1061 | 0.188 | 1116 | 0.22 | 1444 | 0.674 | 632 | 0.14 | 986 | 0.28 | 60 | 0.031 | 14 | 0.026 | 6 | 0.002 | 1983 | 0.996 | 20 | 0.282 | 86 | 0.046 | 27 | 0.035 | 1035 | 0.999 | 49 | 0.03 | 249 | 0.12 | 326 | 1 | 1487 | 0.993 | 709 | 0.681 | 4 | 1 | 1180 | 0.283 | 27 | 9.184 | 0 | 9.184 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7765 | C7765T|(ORF1ab_polyprotein:C7500T(S2500S))|(ORF1a_polyprotein:C7500T(S2500S)) | 1786 | 0.745 | 2832 | 0.731 | 1702 | 1 | 1861 | 0.441 | 248 | 0.289 | 1923 | 0.342 | 5621 | 0.55 | 417 | 0.192 | 1208 | 0.499 | 4217 | 0.948 | 1906 | 0.996 | 9419 | 0.574 | 201 | 0.332 | 3870 | 0.995 | 3729 | 0.997 | 58 | 0.156 | 5413 | 0.473 | 576 | 0.445 | 2762 | 0.997 | 2647 | 0.996 | 3604 | 0.937 | 163 | 0.994 | 3637 | 0.435 | 23 | 15.064 | 0 | 15.064 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8039 | G8039A|(ORF1ab_polyprotein:G7774A(D2592N))|(ORF1a_polyprotein:G7774A(D2592N)) | 3 | 0.001 | 135 | 0.024 | 961 | 0.633 | 1317 | 0.503 | 5513 | 0.533 | 2445 | 0.85 | 158 | 0.51 | 2705 | 0.47 | 134 | 0.096 | 2 | 0.001 | 886 | 0.391 | 1314 | 0.699 | 4632 | 0.998 | 2380 | 0.812 | 16559 | 0.934 | 2378 | 0.489 | 580 | 0.826 | 1855 | 0.999 | 18 | 9.769 | 0 | 9.769 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8123 | C8123T|(ORF1ab_polyprotein:C7858T(L2620F))|(ORF1a_polyprotein:C7858T(L2620F)) | 361 | 0.325 | 413 | 0.355 | 447 | 1 | 105 | 0.981 | 422 | 0.553 | 529 | 0.451 | 295 | 0.414 | 433 | 0.462 | 950 | 0.366 | 3272 | 0.931 | 1515 | 0.48 | 1814 | 0.72 | 453 | 0.452 | 337 | 0.997 | 228 | 0.991 | 87 | 0.382 | 210 | 1 | 658 | 0.287 | 283 | 0.99 | 3560 | 0.998 | 1184 | 0.897 | 17189 | 0.997 | 522 | 1 | 739 | 0.997 | 1812 | 0.996 | 138 | 0.249 | 26 | 18.022 | 0.249 | 18.2709999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8176 | T8176C|(ORF1ab_polyprotein:T7911C(A2637A))|(ORF1a_polyprotein:T7911C(A2637A)) | 347 | 0.313 | 304 | 0.321 | 451 | 0.998 | 103 | 0.99 | 453 | 0.552 | 485 | 0.436 | 310 | 0.422 | 400 | 0.483 | 881 | 0.389 | 2950 | 0.942 | 1170 | 0.496 | 1533 | 0.714 | 339 | 0.432 | 316 | 0.997 | 197 | 0.995 | 79 | 0.395 | 176 | 1 | 460 | 0.25 | 249 | 1 | 2985 | 0.998 | 849 | 0.937 | 14237 | 0.998 | 503 | 1 | 575 | 0.993 | 1489 | 0.999 | 25 | 18.05 | 0 | 18.05 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8264 | G8264A|(ORF1ab_polyprotein:G7999A(G2667S))|(ORF1a_polyprotein:G7999A(G2667S)) | 436 | 0.327 | 462 | 0.336 | 569 | 1 | 137 | 1 | 573 | 0.548 | 714 | 0.439 | 453 | 0.426 | 568 | 0.456 | 1236 | 0.363 | 4426 | 0.907 | 534 | 0.171 | 255 | 0.992 | 99 | 0.297 | 233 | 1 | 667 | 0.259 | 331 | 0.991 | 3504 | 0.694 | 1040 | 0.743 | 16905 | 0.734 | 667 | 0.997 | 866 | 0.999 | 2498 | 0.998 | 22 | 14.677 | 0 | 14.677 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8879 | A8879T|(ORF1ab_polyprotein:A8614T(T2872S))|(ORF1a_polyprotein:A8614T(T2872S)) | 68 | 0.433 | 114 | 0.429 | 12 | 0.226 | 999 | 0.998 | 1134 | 0.516 | 154 | 0.457 | 1587 | 0.394 | 147 | 0.419 | 405 | 0.169 | 9 | 4.041 | 0 | 4.041 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8956 | RATG13 | C8956T|(ORF1ab_polyprotein:C8691T(Y2897Y))|(ORF1a_polyprotein:C8691T(Y2897Y)) | 205 | 0.341 | 11 | 0.038 | 3446 | 0.999 | 143 | 0.454 | 129 | 0.412 | 1050 | 0.434 | 140 | 0.132 | 184 | 0.529 | 1436 | 0.929 | 18 | 0.029 | 1869 | 0.631 | 30 | 0.132 | 2 | 0.4 | 1457 | 0.4 | 964 | 0.944 | 37 | 0.211 | 16 | 0.186 | 15 | 0.011 | 915 | 0.48 | 316 | 0.47 | 2149 | 0.998 | 5748 | 0.997 | 1246 | 0.836 | 3782 | 0.997 | 2269 | 0.999 | 1954 | 1 | 2331 | 0.999 | 27 | 14.988 | 0 | 14.988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9042 | C9042T|(ORF1ab_polyprotein:C8777T(S2926F))|(ORF1a_polyprotein:C8777T(S2926F)) | 194 | 0.354 | 3416 | 0.867 | 175 | 0.462 | 176 | 0.499 | 1441 | 0.496 | 248 | 0.185 | 255 | 0.617 | 1714 | 0.961 | 2853 | 0.705 | 2062 | 0.494 | 1281 | 0.997 | 82 | 0.287 | 29 | 0.287 | 1339 | 0.501 | 281 | 0.471 | 1456 | 0.996 | 4507 | 0.997 | 1525 | 0.886 | 8 | 1 | 2723 | 0.997 | 1873 | 0.998 | 21 | 14.057 | 0 | 14.057 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9209 | G9209A|(ORF1ab_polyprotein:G8944A(E2982K))|(ORF1a_polyprotein:G8944A(E2982K)) | 207 | 0.322 | 215 | 0.264 | 4353 | 0.999 | 243 | 0.518 | 84 | 1 | 613 | 0.58 | 1654 | 0.494 | 511 | 0.231 | 1347 | 0.506 | 2271 | 0.963 | 61 | 0.058 | 30 | 0.192 | 2937 | 0.711 | 8 | 0.471 | 2665 | 0.387 | 162 | 0.38 | 2591 | 0.998 | 88 | 0.201 | 26 | 0.134 | 292 | 0.101 | 1383 | 0.524 | 484 | 0.526 | 1760 | 0.998 | 6050 | 0.998 | 2499 | 0.926 | 29 | 1 | 3207 | 0.999 | 3326 | 0.998 | 628 | 0.998 | 2 | 0.003 | 30 | 17.477 | 0.003 | 17.48 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9693 | RATG13 | C9693T|(ORF1ab_polyprotein:C9428T(A3143V))|(ORF1a_polyprotein:C9428T(A3143V)) | 2331 | 0.267 | 5243 | 0.354 | 14407 | 0.739 | 3899 | 0.673 | 17373 | 0.997 | 4754 | 0.997 | 10359 | 0.326 | 10327 | 0.527 | 15880 | 0.693 | 20717 | 0.934 | 13809 | 0.794 | 7843 | 0.351 | 5076 | 0.972 | 7929 | 0.99 | 918 | 0.441 | 8768 | 0.982 | 911 | 0.492 | 4716 | 0.991 | 10630 | 0.988 | 6041 | 0.956 | 857 | 0.99 | 5818 | 0.99 | 4330 | 0.991 | 23 | 17.435 | 0 | 17.435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9711 | C9711T|(ORF1ab_polyprotein:C9446T(S3149F))|(ORF1a_polyprotein:C9446T(S3149F)) | 2523 | 0.269 | 5507 | 0.356 | 15711 | 0.742 | 4357 | 0.678 | 19170 | 0.996 | 5138 | 0.998 | 14038 | 0.407 | 11002 | 0.53 | 17451 | 0.699 | 22445 | 0.933 | 14747 | 0.807 | 8902 | 0.363 | 5373 | 0.977 | 8615 | 0.999 | 969 | 0.433 | 9499 | 0.998 | 984 | 0.498 | 4964 | 0.998 | 11742 | 0.998 | 6388 | 0.96 | 917 | 0.999 | 6294 | 0.998 | 4784 | 0.995 | 23 | 17.631 | 0 | 17.631 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10440 | C10440T|(ORF1ab_polyprotein:C10175T(A3392V))|(ORF1a_polyprotein:C10175T(A3392V)) | 2054 | 0.285 | 4786 | 0.528 | 22623 | 0.844 | 4370 | 0.62 | 11486 | 0.999 | 2931 | 0.684 | 3025 | 0.297 | 9376 | 0.444 | 5374 | 0.393 | 12663 | 0.615 | 20679 | 0.934 | 466 | 0.147 | 318 | 0.103 | 2936 | 0.471 | 8724 | 0.54 | 4030 | 0.368 | 961 | 0.601 | 12883 | 0.79 | 294 | 0.147 | 3057 | 0.165 | 6391 | 0.998 | 2558 | 0.224 | 2776 | 0.999 | 24736 | 0.998 | 14666 | 0.979 | 7019 | 0.999 | 5815 | 0.997 | 6418 | 0.998 | 14461 | 0.999 | 29 | 18.166 | 0 | 18.166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10825 | T10825A|(ORF1ab_polyprotein:T10560A(T3520T))|(ORF1a_polyprotein:T10560A(T3520T)) | 3 | 0.002 | 699 | 0.246 | 3095 | 0.216 | 875 | 0.1 | 1322 | 0.116 | 1873 | 0.486 | 414 | 0.995 | 1291 | 0.328 | 3928 | 0.983 | 621 | 0.992 | 746 | 0.24 | 155 | 0.156 | 2838 | 0.455 | 762 | 0.988 | 3174 | 0.986 | 2770 | 0.946 | 33 | 1 | 2300 | 0.997 | 4 | 0.001 | 2 | 0.001 | 20 | 10.232 | 0.002 | 10.234 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11080 | T11080C|(ORF1ab_polyprotein:T10815C(F3605F))|(ORF1a_polyprotein:T10815C(F3605F)) | 1183 | 0.219 | 1824 | 0.226 | 3443 | 0.997 | 1995 | 0.911 | 6970 | 0.797 | 4864 | 0.721 | 660 | 0.624 | 2139 | 0.584 | 4035 | 0.418 | 5386 | 0.472 | 10149 | 0.642 | 7771 | 0.924 | 1847 | 0.317 | 954 | 0.132 | 612 | 0.146 | 6228 | 0.508 | 4123 | 0.476 | 1308 | 0.624 | 557 | 0.196 | 2830 | 0.234 | 6577 | 0.749 | 407 | 0.465 | 196 | 0.213 | 575 | 0.047 | 2938 | 0.998 | 3185 | 0.517 | 2031 | 0.997 | 15770 | 0.997 | 8484 | 0.961 | 2872 | 0.999 | 3860 | 0.997 | 679 | 0.101 | 13970 | 0.997 | 33 | 19.206 | 0 | 19.206 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11083 | G11083T|(ORF1ab_polyprotein:G10818T(L3606F))|(ORF1a_polyprotein:G10818T(L3606F)) | 1184 | 0.218 | 1839 | 0.228 | 3444 | 0.998 | 1994 | 0.911 | 6983 | 0.798 | 4868 | 0.722 | 661 | 0.627 | 2144 | 0.585 | 4045 | 0.418 | 5400 | 0.474 | 10156 | 0.642 | 7772 | 0.924 | 1860 | 0.318 | 963 | 0.134 | 616 | 0.147 | 6230 | 0.505 | 4127 | 0.475 | 1309 | 0.625 | 560 | 0.197 | 3 | 0.004 | 2870 | 0.237 | 6592 | 0.75 | 407 | 0.466 | 197 | 0.214 | 588 | 0.048 | 2939 | 0.998 | 3192 | 0.516 | 2031 | 0.997 | 15776 | 0.998 | 8476 | 0.96 | 2873 | 0.999 | 3857 | 0.996 | 684 | 0.102 | 13988 | 0.999 | 16 | 0.001 | 6 | 0.001 | 3 | 0.002 | 4 | 0.001 | 17 | 0.002 | 18 | 0.001 | 16 | 0.002 | 10 | 0.001 | 13 | 0.001 | 43 | 19.23 | 0.012 | 19.242 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11294 | T11294G|(ORF1ab_polyprotein:T11029G(F3677V))|(ORF1a_polyprotein:T11029G(F3677V)) | 575 | 0.12 | 584 | 0.37 | 2238 | 0.362 | 1968 | 0.273 | 1984 | 0.658 | 700 | 0.084 | 3834 | 0.251 | 450 | 0.07 | 1780 | 0.358 | 1037 | 0.163 | 590 | 0.195 | 6952 | 0.521 | 4739 | 0.472 | 2 | 0.002 | 525 | 0.218 | 2156 | 0.184 | 6422 | 0.744 | 219 | 0.991 | 39 | 0.062 | 3443 | 0.998 | 3360 | 0.522 | 1988 | 0.997 | 15970 | 0.998 | 10258 | 0.961 | 3002 | 0.997 | 4138 | 0.999 | 14185 | 0.998 | 27 | 13.568 | 0 | 13.568 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11839 | A11839G|(ORF1ab_polyprotein:A11574G(V3858V))|(ORF1a_polyprotein:A11574G(V3858V)) | 53 | 0.232 | 6 | 1 | 11 | 0.393 | 6 | 1 | 23 | 0.742 | 3 | 0.075 | 12 | 0.571 | 145 | 0.74 | 105 | 0.913 | 13 | 0.464 | 6 | 0.054 | 142 | 0.47 | 85 | 0.383 | 8 | 0.364 | 20 | 1 | 7 | 1 | 35 | 0.31 | 5 | 1 | 107 | 1 | 103 | 1 | 520 | 1 | 24 | 1 | 119 | 1 | 23 | 15.711 | 0 | 15.711 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12212 | T12212G|(ORF1ab_polyprotein:T11947G(S3983A))|(ORF1a_polyprotein:T11947G(S3983A)) | 395 | 0.127 | 751 | 0.36 | 1961 | 0.362 | 302 | 0.067 | 689 | 0.092 | 1421 | 0.154 | 1608 | 0.221 | 6244 | 0.781 | 665 | 1 | 1466 | 0.542 | 2528 | 0.48 | 418 | 0.174 | 5056 | 0.642 | 13 | 5.002 | 0 | 5.002 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12556 | A12556C|(ORF1ab_polyprotein:A12291C(E4097D))|(ORF1a_polyprotein:A12291C(E4097D)) | 1085 | 0.333 | 4081 | 0.683 | 4830 | 0.999 | 638 | 0.792 | 5178 | 0.718 | 1416 | 0.504 | 46 | 0.157 | 777 | 0.279 | 2367 | 0.741 | 4115 | 0.642 | 4640 | 0.926 | 1249 | 0.528 | 848 | 0.388 | 2219 | 0.401 | 2384 | 0.455 | 5765 | 0.45 | 39 | 0.103 | 452 | 0.297 | 3518 | 0.253 | 1654 | 0.652 | 4670 | 0.998 | 85 | 0.419 | 2050 | 0.571 | 2647 | 0.34 | 1324 | 0.998 | 19722 | 0.998 | 9220 | 0.968 | 14176 | 0.998 | 3518 | 0.998 | 1390 | 0.241 | 35344 | 0.999 | 2 | 0.001 | 32 | 18.829 | 0.001 | 18.83 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12769 | G12769A|(ORF1ab_polyprotein:G12504A(A4168A))|(ORF1a_polyprotein:G12504A(A4168A)) | 1775 | 0.323 | 426 | 1 | 2435 | 0.313 | 178 | 0.105 | 428 | 0.121 | 485 | 0.18 | 1147 | 0.479 | 1462 | 0.276 | 533 | 0.19 | 1122 | 0.176 | 2680 | 0.206 | 1540 | 0.987 | 3323 | 0.997 | 2148 | 0.517 | 1112 | 0.509 | 440 | 0.993 | 3696 | 0.74 | 3668 | 0.78 | 223 | 0.736 | 1210 | 0.997 | 5334 | 0.702 | 21 | 11.327 | 0 | 11.327 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12838 | G12838T|(ORF1ab_polyprotein:G12573T(L4191F))|(ORF1a_polyprotein:G12573T(L4191F)) | 1259 | 0.266 | 4818 | 0.664 | 4629 | 0.983 | 665 | 0.951 | 7279 | 0.658 | 1398 | 0.411 | 680 | 0.258 | 1854 | 0.626 | 3501 | 0.486 | 4073 | 0.85 | 1694 | 0.482 | 732 | 0.282 | 2539 | 0.319 | 926 | 0.211 | 3815 | 0.437 | 83 | 0.519 | 651 | 0.244 | 4389 | 0.293 | 2266 | 0.931 | 4777 | 0.99 | 143 | 0.485 | 2944 | 0.525 | 1608 | 0.518 | 570 | 0.889 | 7093 | 0.978 | 6285 | 0.989 | 406 | 0.974 | 2003 | 0.957 | 11799 | 0.992 | 2 | 0.001 | 2 | 0.001 | 13 | 0.001 | 5 | 0.001 | 3 | 0.001 | 34 | 18.168 | 0.005 | 18.173 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13273 | T13273C|(ORF1ab_polyprotein:T13008C(H4336H))|(ORF1a_polyprotein:T13008C(H4336H)) | 1241 | 0.298 | 8870 | 0.443 | 2376 | 0.477 | 5245 | 0.335 | 2305 | 0.488 | 5248 | 0.443 | 5573 | 0.297 | 2019 | 0.257 | 3112 | 0.25 | 921 | 0.046 | 5035 | 0.23 | 8 | 0.001 | 12 | 3.564 | 0.001 | 3.565 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13688 | AAGAAACAATTTATA13688-13702del|(ORF1ab_polyprotein:GAAGAAACAATTTATAAT13423-13440GATdel(EETIYN4475-4480Ddel)) | 1126 | 0.179 | 152 | 0.02 | 2837 | 0.996 | 11489 | 0.712 | 1111 | 0.245 | 58 | 0.02 | 2212 | 0.18 | 1050 | 0.323 | 2165 | 0.076 | 9 | 2.751 | 0 | 2.751 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13827 | TGCTTTAAGGCATT13827-13840del|(ORF1ab_polyprotein:13563-13576del(4521fs)) | 3314 | 0.074 | 3407 | 0.296 | 6032 | 0.926 | 9669 | 0.481 | 2096 | 0.454 | 791 | 0.475 | 1941 | 0.128 | 2862 | 0.165 | 8 | 2.999 | 0 | 2.999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14116 | A14116G|(ORF1ab_polyprotein:A13852G(T4618A)) | 2702 | 0.4 | 1513 | 0.368 | 10578 | 0.658 | 4813 | 0.688 | 11891 | 0.632 | 6502 | 0.602 | 268 | 1 | 3714 | 0.38 | 568 | 0.125 | 6611 | 0.53 | 14662 | 0.907 | 4476 | 0.459 | 1713 | 0.288 | 1786 | 0.277 | 3058 | 0.423 | 22067 | 0.534 | 754 | 0.092 | 392 | 0.125 | 3692 | 0.164 | 2979 | 0.449 | 2293 | 0.46 | 6870 | 0.441 | 276 | 0.345 | 2854 | 0.464 | 8879 | 0.741 | 1157 | 0.394 | 3435 | 0.527 | 15623 | 0.83 | 12391 | 0.754 | 1599 | 0.998 | 11409 | 0.878 | 31 | 15.933 | 0 | 15.933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14176 | ACCTT14176-14180del|(ORF1ab_polyprotein:13912-13916del(4638fs)) | 107 | 0.017 | 3498 | 0.172 | 5022 | 0.512 | 1474 | 0.999 | 2671 | 0.513 | 2081 | 0.155 | 1743 | 0.189 | 27 | 0.05 | 1276 | 0.22 | 9 | 2.827 | 0 | 2.827 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15564 | A15564G|(ORF1ab_polyprotein:A15300G(L5100L)) | 701 | 0.027 | 6837 | 0.186 | 5038 | 0.148 | 15490 | 0.461 | 1813 | 0.156 | 6173 | 0.326 | 9256 | 0.455 | 1597 | 0.619 | 1776 | 0.304 | 6752 | 0.287 | 6355 | 0.316 | 15 | 0.013 | 25 | 0.002 | 13 | 3.3 | 0 | 3.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15906 | G15906A|(ORF1ab_polyprotein:G15642A(Q5214Q)) | 5740 | 0.211 | 6726 | 0.105 | 4636 | 0.088 | 10982 | 0.162 | 8119 | 0.143 | 5206 | 0.268 | 7249 | 0.157 | 7186 | 0.475 | 2790 | 0.192 | 11098 | 0.577 | 4896 | 0.11 | 6249 | 0.173 | 4804 | 0.34 | 5563 | 0.232 | 13673 | 0.369 | 15 | 3.602 | 0 | 3.602 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15960 | RATG13 | C15960T|(ORF1ab_polyprotein:C15696T(A5232A)) | 4402 | 0.139 | 3707 | 0.065 | 22934 | 0.478 | 4625 | 0.157 | 15110 | 0.48 | 4095 | 0.169 | 7710 | 0.203 | 3071 | 0.15 | 3765 | 0.188 | 20092 | 0.549 | 10903 | 0.457 | 9313 | 0.433 | 18560 | 0.468 | 13 | 3.936 | 0 | 3.936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16408 | A16408G|(ORF1ab_polyprotein:A16144G(T5382A)) | 111 | 0.057 | 6217 | 0.487 | 975 | 0.102 | 1307 | 0.07 | 2822 | 0.144 | 1587 | 0.107 | 4297 | 0.213 | 3093 | 0.156 | 6930 | 0.272 | 4390 | 0.838 | 2762 | 0.152 | 2596 | 0.182 | 874 | 0.281 | 6078 | 0.527 | 11607 | 0.431 | 15 | 4.019 | 0 | 4.019 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16542 | T16542C|(ORF1ab_polyprotein:T16278C(N5426N)) | 1770 | 0.206 | 1527 | 0.239 | 4163 | 0.289 | 2760 | 0.338 | 1734 | 0.995 | 4517 | 0.385 | 3558 | 0.461 | 1109 | 0.283 | 5793 | 0.501 | 2547 | 0.439 | 1786 | 0.454 | 8694 | 0.452 | 12 | 5.042 | 0 | 5.042 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16547 | C16547A|(ORF1ab_polyprotein:C16283A(T5428N)) | 5892 | 0.997 | 966 | 0.998 | 4376 | 0.557 | 2611 | 0.305 | 891 | 0.142 | 4991 | 0.376 | 7023 | 0.573 | 1798 | 0.297 | 1021 | 0.156 | 511 | 0.305 | 3197 | 0.378 | 611 | 0.053 | 807 | 0.127 | 13 | 5.264 | 0 | 5.264 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16614 | T16614C|(ORF1ab_polyprotein:T16350C(C5450C)) | 4 | 0.001 | 3667 | 0.366 | 441 | 0.998 | 5028 | 0.451 | 2314 | 0.212 | 2766 | 0.188 | 2645 | 0.619 | 4047 | 0.27 | 1865 | 0.223 | 992 | 0.199 | 10 | 3.527 | 0 | 3.527 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16728 | T16728G|(ORF1ab_polyprotein:T16464G(H5488Q)) | 530 | 0.018 | 7556 | 0.461 | 5683 | 0.999 | 1550 | 0.087 | 8111 | 0.35 | 7408 | 0.606 | 7039 | 0.416 | 1772 | 0.997 | 14385 | 0.609 | 4118 | 0.319 | 3054 | 0.718 | 3149 | 0.347 | 18509 | 0.663 | 11264 | 0.685 | 3069 | 0.646 | 1443 | 0.223 | 18938 | 0.596 | 17 | 8.74 | 0 | 8.74 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16954 | C16954T|(ORF1ab_polyprotein:C16690T(L5564L)) | 1532 | 0.15 | 7614 | 0.462 | 6128 | 0.312 | 2403 | 0.336 | 1496 | 0.298 | 4792 | 0.216 | 3298 | 0.354 | 5611 | 0.307 | 2931 | 0.216 | 1939 | 0.102 | 2737 | 0.15 | 888 | 0.979 | 1532 | 0.221 | 1346 | 0.075 | 723 | 0.049 | 15 | 4.227 | 0 | 4.227 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17235 | T17235C|(ORF1ab_polyprotein:T16971C(I5657I)) | 612 | 0.082 | 287 | 0.133 | 2468 | 0.392 | 1584 | 0.216 | 1875 | 0.168 | 9 | 0.001 | 659 | 0.246 | 2205 | 0.242 | 1243 | 0.115 | 4337 | 0.525 | 2794 | 0.228 | 2313 | 0.324 | 3801 | 0.257 | 2440 | 0.223 | 446 | 0.136 | 2887 | 0.085 | 16 | 3.373 | 0 | 3.373 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18083 | T18083C|(ORF1ab_polyprotein:T17819C(I5940T)) | 94 | 0.182 | 146 | 1 | 2 | 0.007 | 288 | 0.49 | 118 | 0.47 | 374 | 0.304 | 262 | 0.404 | 123 | 0.183 | 277 | 0.453 | 302 | 0.325 | 10 | 3.818 | 0 | 3.818 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18086 | C18086T|(ORF1ab_polyprotein:C17822T(T5941I)) | 29 | 0.341 | 51 | 0.68 | 11 | 1 | 187 | 0.464 | 8 | 0.667 | 62 | 0.517 | 64 | 0.512 | 46 | 0.338 | 219 | 0.944 | 53 | 0.12 | 79 | 0.359 | 43 | 0.12 | 392 | 0.776 | 28 | 0.201 | 18 | 0.164 | 2 | 1 | 146 | 1 | 68 | 0.433 | 504 | 0.589 | 8 | 0.381 | 287 | 0.492 | 119 | 0.474 | 26 | 1 | 1175 | 0.999 | 614 | 0.997 | 642 | 0.995 | 277 | 0.449 | 867 | 0.999 | 28 | 17.011 | 0 | 17.011 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19353 | T19353C|(ORF1ab_polyprotein:T19089C(N6363N)) | 157 | 0.184 | 128 | 0.985 | 72 | 0.585 | 43 | 0.387 | 100 | 0.41 | 60 | 0.204 | 258 | 0.389 | 73 | 0.094 | 138 | 0.676 | 104 | 0.395 | 40 | 0.215 | 38 | 0.146 | 93 | 0.107 | 45 | 0.132 | 92 | 0.322 | 15 | 5.231 | 0 | 5.231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19742 | A19742C|(ORF1ab_polyprotein:A19478C(E6493A)) | 2066 | 0.63 | 10542 | 0.749 | 986 | 0.998 | 14777 | 0.575 | 6533 | 0.513 | 2493 | 0.258 | 5314 | 0.394 | 8277 | 0.496 | 14582 | 0.922 | 9067 | 0.456 | 1324 | 0.266 | 1902 | 0.13 | 6933 | 0.554 | 3436 | 0.176 | 4796 | 0.999 | 11967 | 0.845 | 3169 | 0.995 | 3806 | 0.995 | 6449 | 0.997 | 10768 | 0.996 | 2230 | 0.997 | 4991 | 0.996 | 4499 | 0.996 | 23 | 15.933 | 0 | 15.933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20391 | T20391G|(ORF1ab_polyprotein:T20127G(R6709R)) | 8542 | 0.542 | 720 | 0.317 | 1313 | 0.117 | 5040 | 0.996 | 2847 | 0.412 | 3326 | 0.398 | 1439 | 0.601 | 6102 | 0.489 | 4962 | 0.677 | 553 | 0.197 | 175 | 0.978 | 1269 | 0.285 | 3137 | 0.324 | 2112 | 0.151 | 21 | 0.014 | 2 | 0.015 | 5819 | 0.453 | 12533 | 0.965 | 18 | 0.098 | 10127 | 0.93 | 8356 | 0.674 | 14823 | 0.858 | 8514 | 0.876 | 8230 | 0.951 | 6854 | 0.995 | 6079 | 0.799 | 6839 | 0.996 | 27 | 15.108 | 0 | 15.108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20407 | RATG13 | T20407C|(ORF1ab_polyprotein:T20143C(F6715L)) | 1135 | 0.055 | 363 | 0.028 | 5934 | 0.72 | 4151 | 0.397 | 1558 | 0.494 | 2941 | 0.23 | 6441 | 0.456 | 1018 | 0.514 | 7512 | 0.582 | 9979 | 0.72 | 9128 | 0.456 | 4940 | 0.461 | 4448 | 0.419 | 1178 | 0.113 | 9471 | 0.993 | 15 | 6.638 | 0 | 6.638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20407 | T20407G|(ORF1ab_polyprotein:T20143G(F6715V)) | 2 | 0.001 | 23 | 0.002 | 5 | 0.002 | 143 | 1 | 845 | 0.081 | 17 | 0.001 | 3 | 0.001 | 626 | 1 | 3502 | 0.274 | 7230 | 0.512 | 28 | 0.045 | 392 | 0.995 | 4498 | 0.348 | 9381 | 0.469 | 4903 | 0.457 | 3375 | 0.318 | 8269 | 0.996 | 2 | 0.005 | 20 | 0.001 | 15 | 0.001 | 20 | 6.502 | 0.007 | 6.50899999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20458 | A20458T|(ORF1ab_polyprotein:A20194T(I6732L)) | 1681 | 0.078 | 376 | 0.036 | 4187 | 0.713 | 3394 | 0.36 | 3670 | 0.394 | 2209 | 0.253 | 4701 | 0.439 | 2451 | 0.395 | 5677 | 0.522 | 6457 | 0.684 | 7891 | 0.473 | 4167 | 0.492 | 3022 | 0.429 | 2895 | 0.236 | 5935 | 0.999 | 15 | 6.503 | 0 | 6.503 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21003 | T21003C|(ORF1ab_polyprotein:T20739C(C6913C)) | 12365 | 0.834 | 1518 | 0.404 | 12229 | 0.519 | 1653 | 0.254 | 7937 | 0.986 | 2606 | 0.278 | 9229 | 0.656 | 7553 | 0.844 | 19832 | 0.859 | 9439 | 0.662 | 2911 | 0.424 | 1423 | 0.487 | 6335 | 0.636 | 7607 | 0.605 | 3879 | 0.144 | 37 | 0.002 | 255 | 0.985 | 7689 | 0.463 | 5019 | 0.891 | 3596 | 0.739 | 1038 | 0.326 | 5381 | 0.974 | 12062 | 0.959 | 8267 | 0.956 | 5957 | 0.997 | 7963 | 0.919 | 13270 | 0.939 | 4 | 0.001 | 28 | 17.742 | 0.001 | 17.743 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21123 | G21123T|(ORF1ab_polyprotein:G20859T(G6953G)) | 2323 | 0.593 | 1759 | 0.651 | 10154 | 0.999 | 447 | 0.249 | 1180 | 0.311 | 1964 | 0.645 | 3796 | 0.669 | 4114 | 0.94 | 1872 | 0.998 | 945 | 0.21 | 851 | 0.746 | 3453 | 0.558 | 6287 | 0.631 | 1267 | 0.51 | 1256 | 0.503 | 391 | 1 | 2272 | 0.998 | 3099 | 0.469 | 1591 | 0.465 | 448 | 0.991 | 1656 | 0.97 | 1780 | 0.996 | 26 | 1 | 792 | 0.405 | 2324 | 0.998 | 4 | 0.001 | 26 | 17.505 | 0.001 | 17.506 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21144 | RATG13 | T21144C|(ORF1ab_polyprotein:T20880C(A6960A)) | 2010 | 0.58 | 1475 | 0.615 | 8645 | 0.999 | 344 | 0.254 | 1008 | 0.287 | 1741 | 0.631 | 3373 | 0.661 | 3863 | 0.939 | 1570 | 0.998 | 738 | 0.208 | 739 | 0.73 | 3197 | 0.554 | 2 | 0.003 | 5831 | 0.627 | 1129 | 0.51 | 1203 | 0.496 | 305 | 1 | 2017 | 1 | 2981 | 0.465 | 1461 | 0.454 | 419 | 0.998 | 1580 | 0.997 | 1609 | 0.996 | 19 | 1 | 748 | 0.392 | 2049 | 1 | 2 | 0.001 | 27 | 17.394 | 0.001 | 17.395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21549 | C21549T|(ORF1ab_polyprotein:C21285T(N7095N)) | 700 | 0.118 | 452 | 0.202 | 534 | 0.875 | 572 | 0.198 | 508 | 0.998 | 2620 | 0.63 | 1409 | 0.507 | 9915 | 0.574 | 8372 | 0.688 | 2 | 0.001 | 10 | 4.79 | 0.001 | 4.791 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21617 | A21617G|(surface_glycoprotein:ACA55-57GAA(T19E)) | 2125 | 0.434 | 228 | 0.048 | 92 | 1 | 3152 | 0.817 | 2665 | 0.509 | 2060 | 0.61 | 896 | 0.056 | 1301 | 0.365 | 3921 | 0.264 | 9 | 4.103 | 0 | 4.103 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21618 | C21618A|(surface_glycoprotein:ACA55-57GAA(T19E)) | 2125 | 0.434 | 228 | 0.048 | 92 | 1 | 3152 | 0.817 | 2665 | 0.511 | 2060 | 0.611 | 896 | 0.056 | 1301 | 0.365 | 3921 | 0.264 | 9 | 4.106 | 0 | 4.106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21618 | C21618A|(surface_glycoprotein:C56A(T19K)) | 536 | 0.127 | 3972 | 0.9 | 9568 | 0.862 | 2763 | 0.999 | 6625 | 0.414 | 989 | 0.169 | 6438 | 0.485 | 2197 | 0.308 | 4064 | 0.48 | 8921 | 0.658 | 25589 | 0.916 | 230 | 0.04 | 1832 | 0.199 | 4802 | 0.638 | 4012 | 0.511 | 1413 | 0.2 | 143 | 0.015 | 851 | 0.094 | 556 | 0.114 | 1791 | 0.379 | 10 | 0.002 | 871 | 0.997 | 651 | 0.229 | 645 | 0.997 | 2544 | 0.487 | 1265 | 0.375 | 11866 | 0.747 | 883 | 0.465 | 10823 | 0.73 | 13 | 0.001 | 30 | 13.537 | 0.001 | 13.538 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21657 | RATG13 | T21657C|(surface_glycoprotein:T95C(F32S)) | 277 | 0.045 | 153 | 0.016 | 340 | 0.043 | 2933 | 0.557 | 138 | 0.027 | 58 | 1 | 620 | 0.997 | 3316 | 0.869 | 346 | 0.188 | 396 | 0.995 | 3171 | 0.996 | 2339 | 0.996 | 8910 | 0.999 | 842 | 0.542 | 818 | 0.266 | 8996 | 0.999 | 2 | 0.003 | 17 | 9.535 | 0.003 | 9.538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21758 | CATGCTATA21758-21766del|(surface_glycoprotein:196-204del(HAI66-68del)) | 2025 | 0.978 | 3174 | 0.995 | 1179 | 0.996 | 2034 | 0.312 | 939 | 0.253 | 2033 | 0.287 | 11184 | 0.872 | 598 | 0.342 | 1178 | 0.221 | 1175 | 0.37 | 1941 | 0.993 | 439 | 0.56 | 770 | 0.965 | 13 | 8.144 | 0 | 8.144 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21812 | C21812T|(surface_glycoprotein:C250T(L84L)) | 3475 | 0.996 | 5253 | 0.996 | 2606 | 0.277 | 1502 | 0.295 | 5479 | 0.5 | 11383 | 0.553 | 894 | 0.361 | 803 | 0.115 | 2240 | 0.507 | 9 | 4.6 | 0 | 4.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21859 | RATG13 | C21859T|(surface_glycoprotein:C297T(N99N)) | 5154 | 0.443 | 893 | 0.083 | 379 | 0.018 | 184 | 0.038 | 122 | 0.016 | 177 | 1 | 775 | 0.47 | 50 | 0.039 | 748 | 0.999 | 9 | 3.106 | 0 | 3.106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
linked | 21991 | TTA21991-21993del|(surface_glycoprotein:GTTTAT427-432GTTdel(VY143-144Vdel)) | 77 | 0.085 | 19 | 1 | 1099 | 0.672 | 607 | 0.242 | 323 | 0.23 | 739 | 0.603 | 1017 | 0.65 | 191 | 0.247 | 39 | 0.951 | 572 | 0.747 | 989 | 0.736 | 47 | 0.137 | 885 | 0.923 | 1752 | 0.92 | 1888 | 0.892 | 2783 | 0.921 | 108 | 0.871 | 426 | 0.934 | 415 | 0.509 | 1221 | 0.938 | 1271 | 0.625 | 435 | 0.928 | 4647 | 0.94 | 1605 | 0.955 | 356 | 0.879 | 2322 | 0.929 | 3414 | 0.913 | 9137 | 0.83 | 153 | 0.223 | 11 | 1 | 546 | 0.328 | 279 | 0.946 | 1149 | 0.945 | 913 | 0.941 | 56 | 0.889 | 24 | 0.96 | 117 | 0.929 | 2647 | 0.902 | 1682 | 0.918 | 4931 | 0.879 | 40 | 20.207 | 9.86 | 30.067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22001 | A22001G|(surface_glycoprotein:A439G(K147E)) | 89 | 0.099 | 151 | 0.368 | 457 | 0.998 | 22 | 1 | 1189 | 0.705 | 1401 | 0.547 | 59 | 0.509 | 732 | 0.499 | 562 | 0.998 | 791 | 0.624 | 1244 | 0.78 | 259 | 0.32 | 328 | 0.413 | 634 | 0.434 | 341 | 0.306 | 1158 | 0.604 | 524 | 0.247 | 768 | 0.242 | 75 | 0.543 | 452 | 0.993 | 1219 | 0.238 | 710 | 0.378 | 70 | 0.168 | 1311 | 0.508 | 4 | 0.001 | 3306 | 0.295 | 2 | 0.017 | 27 | 12.817 | 0.017 | 12.834 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22007 | A22007G|(surface_glycoprotein:A445G(N149D)) | 87 | 0.105 | 22 | 1 | 265 | 0.166 | 585 | 0.253 | 136 | 0.098 | 436 | 0.38 | 389 | 0.254 | 393 | 0.523 | 887 | 0.657 | 373 | 0.196 | 465 | 0.227 | 1387 | 0.462 | 68 | 0.519 | 431 | 1 | 846 | 0.994 | 384 | 0.184 | 450 | 0.996 | 4657 | 0.996 | 1676 | 0.996 | 389 | 1 | 1189 | 0.491 | 1881 | 0.539 | 10287 | 0.998 | 4 | 0.005 | 24 | 13.034 | 0.005 | 13.039 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22012 | A22012C|(surface_glycoprotein:A450C(K150N)) | 5 | 0.003 | 3 | 0.001 | 150 | 0.113 | 2 | 0.002 | 166 | 0.114 | 2 | 0.003 | 14 | 0.011 | 8 | 0.008 | 6 | 0.007 | 5 | 0.003 | 9 | 0.005 | 697 | 0.248 | 845 | 0.995 | 5 | 0.005 | 440 | 0.214 | 416 | 0.998 | 3412 | 0.745 | 1182 | 0.678 | 310 | 0.873 | 9 | 0.004 | 1988 | 0.578 | 6587 | 0.675 | 2 | 0.003 | 3 | 0.003 | 2 | 0.005 | 5 | 0.003 | 3 | 0.01 | 2 | 0.002 | 3 | 0.004 | 11 | 0.004 | 3 | 0.002 | 7 | 0.001 | 32 | 6.283 | 0.037 | 6.32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22020 | T22020A|(surface_glycoprotein:T458A(M153K)) | 654 | 0.233 | 792 | 0.999 | 398 | 0.201 | 413 | 0.998 | 3118 | 0.714 | 1090 | 0.648 | 289 | 0.83 | 1837 | 0.552 | 5750 | 0.607 | 9 | 5.782 | 0 | 5.782 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22305 | A22305C|(surface_glycoprotein:A743C(Y248S)) | 34 | 1 | 48 | 0.857 | 103 | 1 | 33 | 1 | 40 | 0.548 | 47 | 0.979 | 6 | 1 | 68 | 1 | 40 | 1 | 114 | 1 | 10 | 9.384 | 0 | 9.384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22332 | G22332A|(surface_glycoprotein:G770A(G257D)) | 36 | 1 | 6 | 0.188 | 43 | 0.796 | 114 | 0.991 | 33 | 1 | 34 | 0.507 | 47 | 0.979 | 6 | 1 | 66 | 1 | 49 | 1 | 109 | 1 | 11 | 9.461 | 0 | 9.461 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22599 | G22599A|(surface_glycoprotein:G1037A(R346K)) | 1311 | 0.836 | 541 | 0.875 | 4585 | 0.998 | 8332 | 0.614 | 857 | 0.563 | 387 | 0.776 | 451 | 0.862 | 1056 | 0.575 | 1838 | 0.718 | 8458 | 0.644 | 837 | 0.239 | 1650 | 0.354 | 2255 | 0.265 | 197 | 0.99 | 724 | 0.41 | 3043 | 0.899 | 1749 | 0.443 | 270 | 0.785 | 94 | 0.445 | 299 | 0.121 | 290 | 0.093 | 706 | 0.153 | 784 | 0.176 | 38 | 0.015 | 2 | 0.001 | 161 | 0.027 | 26 | 12.877 | 0 | 12.877 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22622 | A22622G|(surface_glycoprotein:A1060G(N354D)) | 1288 | 0.842 | 565 | 0.863 | 5184 | 1 | 13762 | 0.98 | 911 | 0.583 | 411 | 0.815 | 1965 | 0.999 | 1981 | 0.732 | 13936 | 0.989 | 2025 | 0.965 | 2800 | 0.82 | 3870 | 0.827 | 7582 | 0.972 | 190 | 0.995 | 811 | 0.419 | 3521 | 0.899 | 3585 | 0.868 | 290 | 0.79 | 1433 | 0.998 | 105 | 0.477 | 1807 | 0.998 | 5357 | 0.999 | 1660 | 0.66 | 3238 | 0.998 | 5012 | 0.997 | 4461 | 0.979 | 2958 | 0.998 | 5307 | 0.998 | 870 | 0.514 | 6958 | 0.997 | 30 | 25.971 | 0 | 25.971 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22633 | A22633C|(surface_glycoprotein:A1071C(R357S)) | 1245 | 0.833 | 535 | 0.855 | 5052 | 0.999 | 13423 | 0.98 | 920 | 0.593 | 391 | 0.796 | 330 | 0.667 | 1904 | 0.998 | 1882 | 0.725 | 13544 | 0.989 | 1996 | 0.969 | 2688 | 0.817 | 3759 | 0.822 | 7326 | 0.972 | 180 | 1 | 770 | 0.408 | 3400 | 0.898 | 3494 | 0.868 | 284 | 0.778 | 1390 | 0.999 | 96 | 0.473 | 1690 | 0.999 | 5201 | 0.996 | 1613 | 0.655 | 3146 | 0.998 | 4854 | 0.998 | 4329 | 0.978 | 2881 | 0.997 | 5206 | 0.998 | 847 | 0.509 | 6829 | 0.999 | 31 | 26.566 | 0 | 26.566 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22661 | G22661T|(surface_glycoprotein:G1099T(V367F)) | 1300 | 0.871 | 512 | 0.866 | 6305 | 0.996 | 15842 | 0.983 | 879 | 0.596 | 376 | 0.823 | 392 | 0.869 | 2522 | 0.998 | 2316 | 0.776 | 16490 | 0.991 | 2396 | 0.968 | 3011 | 0.839 | 4266 | 0.843 | 7771 | 0.975 | 180 | 0.978 | 880 | 0.425 | 3962 | 0.9 | 3955 | 0.881 | 269 | 0.801 | 1663 | 0.998 | 133 | 0.586 | 2109 | 0.999 | 6313 | 0.999 | 1883 | 0.68 | 3485 | 0.997 | 6288 | 0.998 | 5849 | 0.981 | 3521 | 0.997 | 6338 | 0.998 | 1021 | 0.513 | 8792 | 1 | 23 | 0.189 | 32 | 27.125 | 0.189 | 27.314 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22676 | RATG13 | G22676A|(surface_glycoprotein:G1114A(A372T)) | 1284 | 0.881 | 926 | 0.144 | 8679 | 0.539 | 994 | 0.664 | 378 | 0.873 | 6 | 0.013 | 997 | 0.389 | 2385 | 0.805 | 11940 | 0.698 | 2411 | 0.971 | 1973 | 0.568 | 4168 | 0.857 | 7861 | 0.977 | 914 | 0.454 | 4086 | 0.911 | 3922 | 0.893 | 262 | 0.816 | 1672 | 0.999 | 2082 | 0.999 | 3186 | 0.505 | 380 | 0.143 | 3579 | 0.998 | 6376 | 0.998 | 5855 | 0.979 | 3627 | 0.997 | 6479 | 0.999 | 1034 | 0.522 | 9032 | 0.999 | 28 | 20.591 | 0 | 20.591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22783 | C22783A|(surface_glycoprotein:C1221A(V407V)) | 1112 | 0.689 | 2576 | 0.528 | 5080 | 0.729 | 758 | 0.43 | 5650 | 0.993 | 1028 | 0.455 | 362 | 0.355 | 312 | 0.212 | 1829 | 0.392 | 2829 | 0.474 | 1835 | 0.603 | 13114 | 0.953 | 932 | 0.99 | 2260 | 0.407 | 163 | 0.295 | 2151 | 0.391 | 6039 | 0.609 | 228 | 0.251 | 112 | 0.158 | 64 | 1 | 450 | 0.237 | 1826 | 0.696 | 5108 | 0.978 | 107 | 0.543 | 550 | 0.998 | 47 | 0.326 | 854 | 0.998 | 1870 | 0.615 | 683 | 0.661 | 1747 | 0.998 | 9207 | 0.998 | 4869 | 0.997 | 2351 | 0.997 | 2602 | 0.615 | 2100 | 0.505 | 5294 | 0.999 | 36 | 23.075 | 0 | 23.075 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22812 | A22812C|(surface_glycoprotein:A1250C(K417T)) | 867 | 0.625 | 3312 | 0.534 | 4522 | 0.709 | 1367 | 0.538 | 950 | 0.44 | 311 | 0.283 | 834 | 0.386 | 3748 | 0.553 | 5067 | 0.641 | 1049 | 0.465 | 7616 | 0.933 | 1743 | 0.32 | 373 | 0.459 | 1361 | 0.267 | 5259 | 0.51 | 535 | 0.415 | 262 | 0.256 | 4725 | 0.999 | 5 | 0.022 | 446 | 1 | 10036 | 0.998 | 4847 | 0.999 | 1126 | 0.999 | 2451 | 0.518 | 2000 | 0.997 | 25 | 14.866 | 0 | 14.866 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22879 | C22879A|(surface_glycoprotein:C1317A(N439K)) | 430 | 0.052 | 1026 | 0.277 | 3 | 0.015 | 304 | 0.997 | 3712 | 0.579 | 2477 | 0.665 | 531 | 0.662 | 2 | 0.001 | 1450 | 0.45 | 917 | 0.995 | 4 | 0.002 | 11 | 4.693 | 0.002 | 4.69499999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
linked | 22893 | A22893C|(surface_glycoprotein:A1331C(K444T)) | 419 | 0.378 | 2209 | 0.451 | 2478 | 0.577 | 482 | 0.242 | 597 | 0.362 | 222 | 0.255 | 2627 | 0.514 | 2895 | 0.506 | 623 | 0.376 | 4189 | 0.822 | 163 | 1 | 1923 | 0.49 | 1483 | 0.415 | 6287 | 0.75 | 616 | 0.638 | 472 | 0.442 | 3142 | 0.998 | 2 | 0.016 | 1296 | 0.998 | 3 | 0.013 | 281 | 0.976 | 4391 | 0.997 | 2838 | 0.998 | 729 | 0.997 | 1261 | 0.404 | 691 | 0.999 | 214 | 0.754 | 501 | 0.472 | 51 | 1 | 107 | 1 | 3913 | 0.519 | 3 | 0.001 | 32 | 15.614 | 3.746 | 19.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22899 | G22899C|(surface_glycoprotein:G1337C(G446A)) | 6 | 0.005 | 8 | 0.002 | 5 | 0.001 | 3 | 0.003 | 6 | 0.001 | 3 | 0.002 | 548 | 0.062 | 1013 | 0.28 | 275 | 0.996 | 3400 | 0.559 | 2530 | 0.676 | 533 | 0.658 | 1263 | 0.43 | 650 | 0.997 | 2 | 0.002 | 3 | 0.009 | 16 | 4.672 | 0.011 | 4.683 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22907 | T22907A|(surface_glycoprotein:T1345A(Y449N)) | 556 | 0.579 | 2010 | 0.427 | 2550 | 0.637 | 761 | 0.429 | 399 | 0.267 | 161 | 0.202 | 460 | 0.261 | 1906 | 0.416 | 2675 | 0.507 | 495 | 0.305 | 4143 | 0.917 | 592 | 0.157 | 417 | 0.127 | 3220 | 0.391 | 209 | 0.223 | 139 | 0.141 | 6 | 0.001 | 3380 | 0.994 | 3 | 0.014 | 3663 | 0.537 | 1820 | 0.437 | 2 | 0.001 | 3 | 0.003 | 12 | 0.002 | 24 | 7.97 | 0.005 | 7.975 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22907 | T22907A|(surface_glycoprotein:TAT1345-1347AAG(Y449K)) | 283 | 0.993 | 2701 | 0.396 | 1083 | 0.26 | 735 | 0.993 | 1013 | 0.365 | 633 | 0.997 | 6 | 4.004 | 0 | 4.004 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22909 | T22909G|(surface_glycoprotein:TAT1345-1347AAG(Y449K)) | 283 | 0.993 | 2701 | 0.372 | 1083 | 0.241 | 735 | 0.993 | 1013 | 0.371 | 633 | 0.998 | 6 | 3.968 | 0 | 3.968 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22925 | T22925A|(surface_glycoprotein:T1363A(L455M)) | 700 | 0.611 | 2552 | 0.487 | 2905 | 0.691 | 919 | 0.479 | 485 | 0.317 | 173 | 0.196 | 540 | 0.295 | 2344 | 0.492 | 3314 | 0.62 | 509 | 0.33 | 5162 | 0.943 | 163 | 1 | 742 | 0.16 | 191 | 0.297 | 480 | 0.114 | 4614 | 0.489 | 284 | 0.276 | 135 | 0.143 | 3884 | 0.999 | 2 | 0.008 | 331 | 1 | 8936 | 0.997 | 5332 | 0.998 | 1051 | 0.997 | 1282 | 0.396 | 930 | 1 | 2 | 0.004 | 27 | 14.3349999999999 | 0.004 | 14.3389999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
linked | 22992 | G22992A|(surface_glycoprotein:G1430A(S477N)) | 2957 | 1 | 5576 | 0.999 | 4227 | 0.864 | 1931 | 0.999 | 174 | 1 | 2691 | 0.999 | 1499 | 0.998 | 1414 | 0.465 | 6229 | 0.999 | 7003 | 0.893 | 3654 | 0.999 | 8274 | 1 | 701 | 1 | 5210 | 1 | 839 | 0.999 | 5805 | 0.999 | 10921 | 0.998 | 2235 | 0.998 | 1297 | 0.998 | 13 | 1 | 5395 | 0.998 | 1632 | 0.999 | 1489 | 0.993 | 4875 | 0.997 | 213 | 0.991 | 266 | 1 | 149 | 1 | 658 | 0.997 | 1776 | 0.787 | 349 | 1 | 414 | 0.995 | 636 | 0.697 | 4474 | 0.367 | 3389 | 0.498 | 640 | 0.608 | 1431 | 0.65 | 3110 | 0.782 | 333 | 0.095 | 2240 | 1 | 853 | 1 | 1845 | 1 | 1872 | 0.998 | 1258 | 0.998 | 5357 | 0.999 | 1262 | 1 | 417 | 0.998 | 3749 | 0.999 | 2937 | 0.998 | 161 | 1 | 90 | 1 | 1006 | 0.996 | 143 | 1 | 55 | 1 | 1710 | 0.998 | 50 | 1 | 743 | 0.997 | 7526 | 0.996 | 637 | 1 | 1285 | 0.993 | 43 | 1 | 31 | 1 | 222 | 1 | 725 | 1 | 131 | 1 | 116 | 1 | 2059 | 0.998 | 2419 | 0.998 | 1278 | 1 | 68 | 33.661 | 29.966 | 63.627 | ||||||||||||||||||||
23012 | GAA23012-23014del|(surface_glycoprotein:1450-1452del(E484del)) | 181 | 0.022 | 1199 | 1 | 2463 | 0.286 | 401 | 0.073 | 941 | 0.979 | 844 | 0.226 | 1442 | 0.356 | 7 | 2.94199999999999 | 0 | 2.94199999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23013 | A23013T|(surface_glycoprotein:A1451T(E484V)) | 734 | 0.184 | 2419 | 0.501 | 2985 | 0.739 | 726 | 0.444 | 238 | 1 | 731 | 0.257 | 287 | 0.181 | 1966 | 0.656 | 2391 | 0.413 | 3688 | 0.524 | 1508 | 0.346 | 6996 | 0.849 | 1071 | 1 | 915 | 0.198 | 336 | 0.384 | 1262 | 0.201 | 5024 | 0.492 | 303 | 0.122 | 102 | 0.077 | 21 | 1 | 1871 | 0.334 | 430 | 0.224 | 281 | 0.164 | 4258 | 0.849 | 129 | 0.433 | 424 | 0.993 | 15 | 0.087 | 525 | 0.516 | 554 | 0.241 | 187 | 0.334 | 283 | 0.459 | 723 | 0.084 | 2667 | 0.485 | 3 | 0.003 | 3 | 0.002 | 3 | 0.003 | 36 | 14.774 | 0.005 | 14.779 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23018 | RATG13 | T23018C|(surface_glycoprotein:TTT1456-1458CAT(F486H)) | 1049 | 0.999 | 252 | 0.24 | 444 | 0.047 | 730 | 0.068 | 1862 | 0.322 | 424 | 0.227 | 276 | 0.164 | 3727 | 0.801 | 125 | 0.439 | 128 | 0.053 | 187 | 0.334 | 87 | 0.018 | 2 | 0.001 | 13 | 3.712 | 0.001 | 3.713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23019 | T23019A|(surface_glycoprotein:TTT1456-1458CAT(F486H)) | 1049 | 0.999 | 252 | 0.23 | 444 | 0.046 | 730 | 0.066 | 1862 | 0.325 | 424 | 0.227 | 276 | 0.164 | 3727 | 0.801 | 125 | 0.439 | 128 | 0.052 | 187 | 0.334 | 87 | 0.018 | 2 | 0.001 | 13 | 3.701 | 0.001 | 3.702 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23031 | RATG13 | T23031A|(surface_glycoprotein:T1469A(F490Y)) | 634 | 0.127 | 391 | 0.091 | 391 | 0.096 | 856 | 0.522 | 281 | 0.091 | 144 | 0.082 | 868 | 0.143 | 966 | 0.137 | 1591 | 0.291 | 4993 | 0.526 | 1402 | 0.999 | 205 | 0.035 | 444 | 0.246 | 2492 | 0.202 | 6090 | 0.518 | 84 | 0.044 | 2634 | 0.37 | 946 | 0.244 | 539 | 0.172 | 6022 | 0.773 | 241 | 0.404 | 611 | 0.998 | 754 | 0.411 | 207 | 0.078 | 373 | 0.3 | 509 | 0.489 | 1271 | 0.615 | 8683 | 0.838 | 5839 | 0.913 | 693 | 0.576 | 1068 | 0.463 | 2717 | 0.484 | 4834 | 0.767 | 33 | 13.045 | 0 | 13.045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23039 | C23039A|(surface_glycoprotein:C1477A(Q493K)) | 873 | 0.162 | 2087 | 0.481 | 3109 | 0.746 | 967 | 0.549 | 283 | 1 | 725 | 0.218 | 304 | 0.162 | 2161 | 0.675 | 2500 | 0.394 | 3290 | 0.485 | 2253 | 0.361 | 8612 | 0.837 | 800 | 0.126 | 2599 | 0.191 | 6407 | 0.509 | 239 | 0.071 | 100 | 0.048 | 22 | 1 | 21 | 0.085 | 509 | 0.175 | 2 | 0.001 | 21 | 8.276 | 0 | 8.276 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23039 | C23039A|(surface_glycoprotein:CAA1477-1479ACA(Q493T)) | 1706 | 0.998 | 454 | 0.222 | 3169 | 0.352 | 1114 | 0.21 | 650 | 0.15 | 6914 | 0.705 | 295 | 0.353 | 708 | 0.992 | 892 | 0.368 | 298 | 0.102 | 461 | 0.271 | 673 | 0.439 | 2324 | 0.997 | 11138 | 0.996 | 6804 | 0.956 | 1314 | 0.998 | 1165 | 0.434 | 2884 | 0.411 | 6941 | 0.998 | 19 | 10.952 | 0 | 10.952 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23040 | A23040C|(surface_glycoprotein:CAA1477-1479ACA(Q493T)) | 1706 | 0.998 | 454 | 0.222 | 3169 | 0.355 | 1114 | 0.211 | 650 | 0.15 | 6914 | 0.704 | 295 | 0.353 | 708 | 0.992 | 892 | 0.368 | 298 | 0.103 | 461 | 0.271 | 673 | 0.439 | 2324 | 0.997 | 11138 | 0.996 | 6804 | 0.956 | 1314 | 0.998 | 1165 | 0.441 | 2884 | 0.412 | 6941 | 0.998 | 19 | 10.964 | 0 | 10.964 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23042 | T23042C|(surface_glycoprotein:T1480C(S494P)) | 176 | 0.03 | 1674 | 0.381 | 1982 | 0.479 | 283 | 1 | 443 | 0.127 | 147 | 0.07 | 93 | 0.029 | 1530 | 0.234 | 2490 | 0.36 | 463 | 0.071 | 2852 | 0.272 | 592 | 0.09 | 770 | 0.055 | 238 | 0.065 | 21 | 0.955 | 21 | 0.079 | 506 | 0.167 | 115 | 0.015 | 355 | 0.04 | 19 | 4.479 | 0.04 | 4.519 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23049 | G23049T|(surface_glycoprotein:G1487T(G496V)) | 966 | 0.233 | 425 | 0.268 | 176 | 0.046 | 2047 | 0.651 | 1105 | 0.154 | 1397 | 0.192 | 2758 | 0.217 | 1821 | 0.948 | 167 | 0.024 | 2544 | 0.176 | 4233 | 0.339 | 3635 | 0.389 | 746 | 0.149 | 4273 | 0.393 | 1014 | 0.357 | 1132 | 0.347 | 543 | 0.261 | 602 | 0.327 | 2523 | 0.998 | 11274 | 0.997 | 7161 | 0.967 | 1336 | 0.996 | 1269 | 0.478 | 3094 | 0.409 | 7371 | 0.997 | 25 | 11.313 | 0 | 11.313 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23054 | RATG13 | C23054T|(surface_glycoprotein:CAA1492-1494TAC(Q498Y)) | 106 | 0.017 | 1321 | 0.382 | 1600 | 0.441 | 445 | 0.304 | 743 | 0.997 | 850 | 0.239 | 111 | 0.052 | 158 | 0.053 | 2511 | 0.395 | 1856 | 0.296 | 2557 | 0.333 | 6601 | 0.54 | 88 | 0.043 | 760 | 0.115 | 492 | 0.22 | 272 | 0.019 | 1492 | 0.12 | 164 | 0.044 | 57 | 0.983 | 1319 | 0.217 | 3028 | 0.28 | 343 | 0.341 | 818 | 0.999 | 57 | 0.186 | 638 | 0.212 | 291 | 0.154 | 26 | 7.982 | 0 | 7.982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23056 | RATG13 | A23056C|(surface_glycoprotein:A1494C(Q498H)) | 838 | 0.14 | 388 | 0.119 | 1058 | 0.302 | 447 | 0.333 | 99 | 0.028 | 231 | 0.107 | 2004 | 0.71 | 918 | 0.151 | 1232 | 0.162 | 3937 | 0.329 | 1918 | 0.955 | 164 | 0.025 | 2604 | 0.184 | 4997 | 0.415 | 87 | 0.039 | 3782 | 0.414 | 775 | 0.158 | 4398 | 0.414 | 1035 | 0.362 | 476 | 0.169 | 569 | 0.27 | 652 | 0.35 | 2572 | 0.998 | 11110 | 0.998 | 7121 | 0.975 | 1338 | 0.993 | 1091 | 0.455 | 2852 | 0.392 | 7116 | 0.999 | 29 | 11.946 | 0 | 11.946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23056 | RATG13 | A23056C|(surface_glycoprotein:CAA1492-1494TAC(Q498Y)) | 106 | 0.018 | 1321 | 0.405 | 1600 | 0.456 | 445 | 0.332 | 743 | 0.997 | 850 | 0.242 | 111 | 0.052 | 158 | 0.056 | 2511 | 0.401 | 1856 | 0.304 | 2557 | 0.337 | 6601 | 0.552 | 88 | 0.044 | 760 | 0.118 | 492 | 0.22 | 272 | 0.019 | 1492 | 0.124 | 164 | 0.045 | 57 | 0.983 | 1319 | 0.222 | 3028 | 0.285 | 343 | 0.336 | 818 | 0.999 | 57 | 0.191 | 638 | 0.226 | 291 | 0.156 | 26 | 8.12 | 0 | 8.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23057 | C23057A|(surface_glycoprotein:C1495A(P499T)) | 1915 | 0.954 | 2606 | 0.184 | 805 | 0.066 | 3782 | 0.413 | 776 | 0.157 | 4401 | 0.414 | 1037 | 0.362 | 1115 | 0.394 | 569 | 0.269 | 652 | 0.349 | 2566 | 0.995 | 10920 | 0.981 | 7132 | 0.976 | 1303 | 0.967 | 1091 | 0.455 | 2852 | 0.391 | 7114 | 0.999 | 2 | 0.001 | 18 | 9.326 | 0.001 | 9.327 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23064 | A23064C|(surface_glycoprotein:A1502C(N501T)) | 1264 | 0.191 | 1717 | 0.535 | 2688 | 0.785 | 983 | 0.704 | 795 | 0.999 | 1282 | 0.325 | 437 | 0.185 | 2293 | 0.783 | 2804 | 0.429 | 3038 | 0.491 | 5339 | 0.544 | 11725 | 0.871 | 2714 | 1 | 1119 | 0.162 | 669 | 0.258 | 3469 | 0.222 | 7326 | 0.549 | 162 | 0.044 | 92 | 0.039 | 69 | 1 | 5180 | 0.466 | 1844 | 0.24 | 1007 | 0.16 | 9195 | 0.688 | 490 | 0.358 | 1030 | 0.998 | 88 | 0.25 | 1347 | 0.365 | 1641 | 0.478 | 782 | 0.282 | 1301 | 0.518 | 3126 | 0.998 | 12074 | 0.999 | 7886 | 0.969 | 1472 | 0.998 | 1374 | 0.509 | 3243 | 0.376 | 8326 | 0.999 | 38 | 20.767 | 0 | 20.767 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23077 | C23077T|(surface_glycoprotein:C1515T(Y505Y)) | 90 | 0.012 | 1176 | 0.382 | 1751 | 0.583 | 852 | 1 | 856 | 0.184 | 85 | 0.033 | 212 | 0.078 | 1743 | 0.258 | 1797 | 0.29 | 1016 | 0.093 | 4122 | 0.267 | 1114 | 0.151 | 542 | 0.041 | 148 | 0.036 | 70 | 0.972 | 106 | 0.263 | 1022 | 0.261 | 73 | 0.009 | 18 | 4.913 | 0 | 4.913 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23274 | A23274G|(surface_glycoprotein:A1712G(D571G)) | 3544 | 0.201 | 2501 | 0.111 | 2876 | 0.365 | 6874 | 0.366 | 2328 | 0.128 | 635 | 0.059 | 4681 | 0.189 | 10779 | 0.356 | 13616 | 0.367 | 4105 | 0.261 | 2561 | 0.077 | 9917 | 0.396 | 20 | 0.001 | 3989 | 0.195 | 9943 | 0.444 | 7362 | 0.277 | 2610 | 0.359 | 1892 | 0.187 | 1435 | 0.262 | 1003 | 0.151 | 1300 | 0.063 | 3345 | 0.152 | 1416 | 0.567 | 2384 | 0.109 | 5295 | 0.29 | 25 | 5.933 | 0 | 5.933 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23277 | C23277A|(surface_glycoprotein:C1715A(T572N)) | 1992 | 0.07 | 1692 | 0.181 | 792 | 0.037 | 10412 | 0.413 | 2089 | 0.071 | 4476 | 0.156 | 2282 | 0.066 | 8265 | 0.202 | 5999 | 0.351 | 4844 | 0.289 | 5843 | 0.154 | 4174 | 0.147 | 3186 | 0.253 | 1972 | 0.16 | 12026 | 0.423 | 856 | 0.127 | 2143 | 0.995 | 3722 | 0.488 | 5541 | 0.839 | 18796 | 0.887 | 17399 | 0.75 | 1068 | 0.379 | 5969 | 0.997 | 4933 | 0.199 | 12627 | 0.649 | 4 | 0.002 | 26 | 9.283 | 0.002 | 9.285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23844 | C23844G|(surface_glycoprotein:C2282G(T761R)) | 1365 | 0.526 | 727 | 0.247 | 649 | 0.317 | 597 | 0.14 | 686 | 0.197 | 1492 | 0.136 | 3826 | 0.314 | 437 | 0.307 | 486 | 0.334 | 62 | 0.29 | 1644 | 0.288 | 2501 | 0.302 | 1269 | 0.235 | 732 | 0.051 | 7571 | 0.319 | 15 | 4.003 | 0 | 4.003 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24044 | C24044T|(surface_glycoprotein:C2482T(L828F)) | 267 | 0.548 | 1154 | 0.738 | 650 | 0.356 | 3692 | 0.999 | 26 | 0.107 | 20 | 1 | 270 | 0.576 | 162 | 0.45 | 654 | 0.653 | 828 | 0.881 | 375 | 0.507 | 77 | 0.118 | 5450 | 0.809 | 788 | 0.345 | 1097 | 0.999 | 3 | 0.158 | 2155 | 0.999 | 956 | 0.998 | 2434 | 0.997 | 1873 | 0.998 | 22 | 1 | 3747 | 0.999 | 3285 | 0.429 | 2356 | 0.996 | 24 | 16.66 | 0 | 16.66 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24872 | G24872A|(surface_glycoprotein:G3310A(V1104I)) | 691 | 0.526 | 667 | 0.379 | 2210 | 0.524 | 1103 | 0.322 | 1302 | 0.476 | 825 | 0.486 | 31 | 0.009 | 5336 | 0.546 | 4340 | 0.817 | 2295 | 0.22 | 508 | 0.318 | 460 | 0.498 | 2378 | 0.476 | 3548 | 0.698 | 4482 | 0.534 | 1127 | 0.285 | 5108 | 0.506 | 1274 | 0.485 | 171 | 0.253 | 2258 | 0.527 | 10 | 0.909 | 2732 | 0.588 | 1396 | 0.416 | 959 | 0.616 | 3369 | 0.608 | 25 | 12.022 | 0 | 12.022 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24902 | A24902G|(surface_glycoprotein:A3340G(I1114V)) | 1084 | 0.275 | 389 | 0.075 | 3582 | 0.392 | 1253 | 0.281 | 430 | 0.086 | 672 | 0.193 | 2958 | 0.319 | 1152 | 0.49 | 1692 | 0.407 | 1633 | 0.541 | 473 | 0.341 | 1690 | 0.357 | 12 | 3.757 | 0 | 3.757 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25020 | A25020C|(surface_glycoprotein:A3458C(D1153A)) | 3 | 0.001 | 631 | 0.531 | 864 | 0.661 | 3109 | 0.813 | 926 | 0.283 | 918 | 0.429 | 588 | 0.458 | 19 | 0.006 | 3945 | 0.499 | 4030 | 0.901 | 6014 | 0.62 | 419 | 0.294 | 442 | 0.516 | 3574 | 0.733 | 3279 | 0.77 | 4095 | 0.528 | 1762 | 0.482 | 7400 | 0.824 | 2296 | 0.997 | 134 | 0.239 | 1909 | 0.505 | 7 | 1 | 3996 | 0.997 | 2805 | 0.942 | 1446 | 0.999 | 4942 | 0.998 | 4 | 0.019 | 27 | 16.026 | 0.019 | 16.0449999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25057 | T25057G|(surface_glycoprotein:T3495G(D1165E)) | 1175 | 0.319 | 398 | 0.075 | 4817 | 0.443 | 1680 | 0.34 | 452 | 0.103 | 2079 | 0.489 | 3782 | 0.359 | 2585 | 0.991 | 3488 | 0.736 | 2314 | 0.808 | 831 | 0.487 | 3928 | 0.609 | 12 | 5.759 | 0 | 5.759 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25103 | A25103G|(surface_glycoprotein:A3541G(K1181E)) | 1844 | 0.255 | 3787 | 0.309 | 4044 | 0.394 | 1073 | 0.1 | 1418 | 0.227 | 543 | 0.378 | 1632 | 0.433 | 8 | 0.002 | 1251 | 0.147 | 3274 | 0.222 | 5558 | 0.366 | 3948 | 0.273 | 267 | 0.022 | 222 | 0.055 | 2536 | 0.185 | 7946 | 0.632 | 1641 | 0.25 | 2562 | 0.164 | 2775 | 0.218 | 5112 | 0.515 | 3917 | 0.794 | 655 | 0.998 | 2472 | 0.624 | 2278 | 0.26 | 3146 | 0.423 | 530 | 0.51 | 1549 | 0.395 | 27 | 9.151 | 0 | 9.151 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25135 | RATG13 | G25135A|(surface_glycoprotein:G3573A(K1191K)) | 4884 | 0.325 | 5666 | 0.446 | 1066 | 0.171 | 1720 | 0.184 | 2558 | 0.201 | 4040 | 0.247 | 3673 | 0.289 | 1782 | 0.118 | 4580 | 0.32 | 2250 | 0.447 | 3332 | 0.637 | 679 | 0.081 | 2816 | 0.336 | 13 | 3.802 | 0 | 3.802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25163 | C25163A|(surface_glycoprotein:C3601A(Q1201K)) | 2478 | 0.32 | 4786 | 0.326 | 5497 | 0.445 | 1433 | 0.208 | 2075 | 0.486 | 1646 | 0.18 | 2640 | 0.205 | 6567 | 0.427 | 3822 | 0.317 | 1803 | 0.121 | 9974 | 0.655 | 2143 | 0.495 | 15 | 0.001 | 3908 | 0.272 | 3196 | 0.605 | 7 | 0.001 | 4214 | 0.997 | 22 | 0.001 | 873 | 0.997 | 3301 | 0.668 | 2208 | 0.321 | 4778 | 0.578 | 16 | 0.001 | 37 | 0.002 | 2 | 0.004 | 12 | 0.001 | 26 | 8.626 | 0.008 | 8.63399999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25163 | C25163A|(surface_glycoprotein:CAA3601-3603AAT(Q1201N)) | 3463 | 0.281 | 4208 | 0.504 | 4573 | 0.426 | 2924 | 0.32 | 2405 | 0.187 | 6319 | 0.411 | 2080 | 0.393 | 5117 | 0.996 | 7999 | 0.513 | 1629 | 0.33 | 4125 | 0.599 | 3145 | 0.38 | 26 | 1 | 13 | 6.34 | 0 | 6.34 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25165 | A25165T|(surface_glycoprotein:CAA3601-3603AAT(Q1201N)) | 3463 | 0.275 | 4208 | 0.505 | 4573 | 0.426 | 2924 | 0.312 | 2405 | 0.185 | 6319 | 0.394 | 2080 | 0.389 | 5117 | 0.996 | 7999 | 0.513 | 1629 | 0.321 | 4125 | 0.582 | 3145 | 0.369 | 26 | 1 | 13 | 6.267 | 0 | 6.267 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25353 | T25353C|(surface_glycoprotein:T3791C(V1264A)) | 2139 | 0.231 | 29 | 0.002 | 1427 | 0.084 | 4672 | 0.51 | 4215 | 0.421 | 739 | 0.096 | 18 | 0.015 | 1727 | 0.334 | 111 | 0.02 | 2151 | 0.227 | 3798 | 0.246 | 10230 | 0.539 | 3854 | 0.297 | 284 | 0.014 | 7506 | 0.545 | 5 | 0.001 | 29 | 0.004 | 3878 | 0.261 | 5398 | 0.842 | 5239 | 0.998 | 4106 | 0.897 | 9997 | 0.566 | 656 | 0.674 | 5088 | 0.996 | 8532 | 0.899 | 8195 | 0.883 | 188 | 0.24 | 537 | 0.207 | 28 | 11.049 | 0 | 11.049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25398 | T25398C|(ORF3a_protein:T6C(D2D)) | 925 | 0.07 | 307 | 0.03 | 79 | 0.023 | 2810 | 0.256 | 7 | 0.001 | 2946 | 0.255 | 3036 | 0.497 | 3479 | 0.887 | 425 | 0.425 | 1535 | 0.34 | 1749 | 0.189 | 1147 | 0.146 | 503 | 0.352 | 2955 | 0.603 | 14 | 4.074 | 0 | 4.074 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25420 | RATG13 | A25420C|(ORF3a_protein:A28C(I10L)) | 463 | 0.1 | 568 | 0.049 | 416 | 0.026 | 2539 | 0.293 | 137 | 0.046 | 4337 | 0.488 | 2247 | 0.235 | 4932 | 0.935 | 2616 | 0.994 | 2645 | 0.833 | 5557 | 0.526 | 282 | 0.303 | 3158 | 0.996 | 7731 | 0.995 | 6076 | 0.935 | 1526 | 0.997 | 3227 | 0.597 | 17 | 9.348 | 0 | 9.348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25535 | T25535C|(ORF3a_protein:T143C(V48A)) | 797 | 0.3 | 206 | 0.741 | 5725 | 0.998 | 476 | 0.494 | 516 | 0.318 | 145 | 0.119 | 854 | 0.532 | 906 | 0.503 | 467 | 0.326 | 1411 | 0.54 | 3152 | 0.891 | 577 | 0.477 | 76 | 0.38 | 3205 | 0.4 | 1386 | 0.64 | 260 | 0.239 | 432 | 0.276 | 1683 | 0.865 | 7 | 1 | 33 | 0.2 | 657 | 0.604 | 2256 | 0.998 | 1464 | 0.973 | 1139 | 0.997 | 3550 | 0.998 | 5 | 0.003 | 26 | 14.809 | 0.003 | 14.812 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25587 | C25587A|(ORF3a_protein:C195A(L65L)) | 875 | 0.297 | 215 | 0.676 | 6344 | 0.998 | 531 | 0.522 | 570 | 0.301 | 140 | 0.103 | 953 | 0.554 | 981 | 0.499 | 528 | 0.321 | 1582 | 0.568 | 3547 | 0.901 | 615 | 0.467 | 77 | 0.383 | 3392 | 0.415 | 1467 | 0.638 | 296 | 0.254 | 497 | 0.292 | 1813 | 0.87 | 5 | 1 | 33 | 0.176 | 723 | 0.61 | 2377 | 0.996 | 1698 | 0.98 | 1219 | 0.994 | 3861 | 1 | 471 | 0.134 | 26 | 14.815 | 0.134 | 14.949 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25645 | RATG13 | T25645C|(ORF3a_protein:T253C(L85L)) | 390 | 0.109 | 5811 | 0.723 | 354 | 0.265 | 1207 | 0.554 | 310 | 0.118 | 359 | 0.189 | 10 | 0.003 | 1573 | 0.299 | 1384 | 0.141 | 382 | 0.274 | 3 | 0.001 | 28 | 0.111 | 90 | 0.039 | 86 | 0.06 | 2945 | 0.586 | 3 | 0.003 | 16 | 3.472 | 0.003 | 3.475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25913 | G25913A|(ORF3a_protein:G521A(G174D)) | 144 | 0.113 | 1254 | 0.34 | 179 | 0.232 | 919 | 0.33 | 14 | 0.005 | 1245 | 0.199 | 1342 | 0.555 | 2525 | 0.81 | 3 | 0.002 | 201 | 0.133 | 2629 | 0.429 | 144 | 0.144 | 818 | 1 | 685 | 1 | 48 | 0.111 | 159 | 1 | 457 | 0.998 | 1418 | 0.997 | 1485 | 0.996 | 6 | 1 | 937 | 1 | 1453 | 0.999 | 5 | 0.003 | 5 | 0.002 | 2 | 0.002 | 5 | 0.002 | 2 | 0.001 | 27 | 12.393 | 0.01 | 12.403 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25928 | T25928C|(ORF3a_protein:T536C(I179T)) | 157 | 0.119 | 363 | 0.093 | 191 | 0.24 | 526 | 0.181 | 530 | 0.079 | 705 | 0.274 | 1747 | 0.522 | 52 | 0.032 | 2767 | 0.434 | 137 | 0.133 | 864 | 1 | 710 | 0.996 | 176 | 1 | 476 | 0.998 | 1518 | 0.998 | 1456 | 0.938 | 5 | 0.833 | 974 | 1 | 1573 | 0.997 | 19 | 10.8669999999999 | 0 | 10.8669999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25936 | C25936G|(ORF3a_protein:C544G(H182D)) | 175 | 0.123 | 1473 | 0.337 | 230 | 0.274 | 1071 | 0.335 | 14 | 0.004 | 1545 | 0.217 | 1662 | 0.593 | 3099 | 0.837 | 229 | 0.131 | 3050 | 0.451 | 165 | 0.146 | 4 | 0.001 | 988 | 0.998 | 814 | 0.996 | 72 | 0.139 | 190 | 0.995 | 544 | 0.996 | 1839 | 0.997 | 1822 | 0.998 | 4 | 1 | 1170 | 0.995 | 1905 | 0.998 | 22 | 12.561 | 0 | 12.561 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25947 | G25947T|(ORF3a_protein:G555T(Q185H)) | 171 | 0.119 | 397 | 0.081 | 263 | 0.295 | 529 | 0.153 | 553 | 0.073 | 819 | 0.267 | 2365 | 0.522 | 61 | 0.032 | 3040 | 0.434 | 166 | 0.132 | 1157 | 0.991 | 874 | 0.992 | 215 | 0.995 | 650 | 0.992 | 2311 | 0.988 | 1985 | 0.928 | 4 | 1 | 1406 | 0.991 | 2472 | 0.996 | 3 | 0.001 | 20 | 10.981 | 0.001 | 10.982 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25991 | G25991A|(ORF3a_protein:G599A(C200Y)) | 2883 | 0.357 | 13632 | 0.74 | 172 | 0.109 | 927 | 0.467 | 4495 | 0.526 | 2145 | 0.243 | 6838 | 0.428 | 5814 | 0.338 | 6738 | 0.485 | 7474 | 0.611 | 11553 | 0.884 | 1904 | 0.209 | 695 | 0.171 | 5615 | 0.581 | 5444 | 0.513 | 2074 | 0.152 | 855 | 0.285 | 2846 | 0.341 | 6261 | 0.804 | 1081 | 0.999 | 237 | 0.145 | 2746 | 0.341 | 113 | 0.056 | 526 | 0.998 | 4384 | 0.998 | 4380 | 0.944 | 1483 | 0.997 | 1214 | 0.501 | 1914 | 0.385 | 1952 | 0.999 | 30 | 15.607 | 0 | 15.607 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26047 | T26047G|(ORF3a_protein:T655G(L219V)) | 5023 | 0.192 | 15773 | 0.267 | 4506 | 0.994 | 7772 | 0.335 | 5104 | 0.144 | 5698 | 0.119 | 4142 | 0.127 | 11071 | 0.33 | 21052 | 0.526 | 5483 | 0.228 | 1873 | 0.146 | 11522 | 0.405 | 8545 | 0.394 | 7219 | 0.386 | 16811 | 0.767 | 1984 | 0.988 | 6046 | 0.295 | 9518 | 0.994 | 9860 | 0.827 | 5256 | 0.998 | 6787 | 0.994 | 21 | 10.456 | 0 | 10.456 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26110 | C26110T|(ORF3a_protein:C718T(P240S)) | 2782 | 0.059 | 1069 | 0.042 | 1543 | 0.049 | 4349 | 0.248 | 1807 | 0.191 | 3037 | 0.139 | 1915 | 0.13 | 8479 | 0.498 | 1644 | 0.998 | 5764 | 0.762 | 5122 | 0.532 | 1915 | 0.466 | 4961 | 0.998 | 13 | 5.112 | 0 | 5.112 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26116 | G26116A|(ORF3a_protein:G724A(E242K)) | 4597 | 0.258 | 1925 | 0.2 | 3215 | 0.146 | 2008 | 0.136 | 9035 | 0.513 | 1730 | 0.994 | 5995 | 0.765 | 5472 | 0.546 | 2013 | 0.479 | 5105 | 0.996 | 10 | 5.033 | 0 | 5.033 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26125 | C26125A|(ORF3a_protein:C733A(Q245K)) | 1304 | 0.071 | 24028 | 0.546 | 5 | 0.001 | 5 | 0.001 | 1525 | 0.093 | 12736 | 0.373 | 4676 | 0.138 | 6210 | 0.258 | 3719 | 0.155 | 9305 | 0.31 | 4223 | 0.26 | 1800 | 0.199 | 6013 | 0.294 | 2158 | 0.114 | 3332 | 0.12 | 2481 | 0.226 | 49 | 0.004 | 3785 | 0.28 | 10877 | 0.675 | 71 | 0.003 | 1556 | 0.995 | 320 | 0.095 | 4 | 0.001 | 32 | 0.002 | 6 | 0.001 | 5730 | 0.816 | 5497 | 0.586 | 1773 | 0.475 | 2 | 0.001 | 4482 | 0.997 | 8 | 0.003 | 41 | 0.002 | 26 | 0.001 | 44 | 0.002 | 57 | 0.001 | 19 | 0.001 | 19 | 0.006 | 45 | 0.001 | 55 | 0.003 | 35 | 0.004 | 11 | 0.002 | 4 | 0.001 | 9 | 0.002 | 6 | 0.001 | 44 | 8.09 | 0.03 | 8.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26187 | T26187A|(ORF3a_protein:T795A(D265E)) | 5269 | 0.311 | 26825 | 0.682 | 3068 | 0.999 | 6779 | 0.474 | 4082 | 0.183 | 12667 | 0.381 | 8938 | 0.289 | 8461 | 0.382 | 9834 | 0.465 | 19786 | 0.805 | 4027 | 0.255 | 1699 | 0.215 | 11658 | 0.619 | 7666 | 0.467 | 3283 | 0.128 | 2066 | 0.244 | 5106 | 0.424 | 11775 | 0.791 | 1428 | 0.997 | 330 | 0.104 | 4906 | 0.34 | 6535 | 0.997 | 7811 | 0.897 | 3427 | 0.999 | 4141 | 0.996 | 25 | 13.444 | 0 | 13.444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26483 | TAT26483-26485del | 905 | 0.527 | 10575 | 0.598 | 734 | 0.496 | 3958 | 0.972 | 3464 | 0.448 | 2223 | 0.287 | 11152 | 0.537 | 12786 | 0.679 | 13251 | 0.818 | 776 | 0.231 | 854 | 0.21 | 5985 | 0.447 | 837 | 0.113 | 961 | 0.935 | 2841 | 0.913 | 240 | 0.234 | 496 | 0.961 | 2227 | 0.908 | 5428 | 0.931 | 5417 | 0.931 | 88 | 0.547 | 1996 | 0.903 | 2734 | 0.926 | 23 | 14.552 | 0 | 14.552 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26526 | G26526A|(membrane_glycoprotein:G4A(A2T)) | 4157 | 0.999 | 1695 | 0.072 | 1687 | 0.083 | 897 | 0.238 | 3 | 0.001 | 969 | 0.214 | 6224 | 0.463 | 11 | 0.017 | 2155 | 0.996 | 4041 | 0.665 | 3602 | 0.575 | 44 | 0.267 | 1824 | 0.997 | 11 | 0.001 | 16 | 0.002 | 21 | 0.001 | 5 | 0.001 | 13 | 0.003 | 3 | 0.009 | 19 | 5.587 | 0.017 | 5.604 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26526 | GCA26526-26528del|(membrane_glycoprotein:4-6del(A2del)) | 188 | 0.009 | 903 | 0.996 | 377 | 1 | 1878 | 0.313 | 2331 | 0.378 | 50 | 0.307 | 3214 | 0.999 | 7 | 4.002 | 0 | 4.002 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26533 | C26533T|(membrane_glycoprotein:C11T(S4F)) | 1074 | 0.573 | 13585 | 0.62 | 1094 | 0.57 | 4220 | 0.999 | 4858 | 0.504 | 2855 | 0.304 | 13609 | 0.577 | 16200 | 0.723 | 17641 | 0.877 | 829 | 0.215 | 936 | 0.198 | 5892 | 0.437 | 949 | 0.116 | 1039 | 0.998 | 3221 | 1 | 283 | 0.22 | 376 | 0.997 | 1503 | 0.697 | 5884 | 0.998 | 5668 | 0.907 | 100 | 0.585 | 1784 | 0.999 | 3833 | 0.999 | 23 | 15.113 | 0 | 15.113 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26538 | G26538A|(membrane_glycoprotein:G16A(G6S)) | 978 | 0.548 | 1883 | 0.086 | 1096 | 0.582 | 4175 | 0.999 | 3437 | 0.382 | 4398 | 0.188 | 7731 | 0.36 | 12363 | 0.625 | 807 | 0.218 | 868 | 0.194 | 5634 | 0.442 | 953 | 0.12 | 1058 | 0.998 | 3172 | 0.997 | 439 | 0.998 | 2024 | 0.996 | 5852 | 0.997 | 5923 | 0.964 | 103 | 0.609 | 1960 | 0.998 | 3921 | 0.996 | 21 | 13.297 | 0 | 13.297 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26554 | A26554G|(membrane_glycoprotein:A32G(E11G)) | 1587 | 0.082 | 579 | 0.03 | 833 | 0.26 | 923 | 0.24 | 3775 | 0.351 | 1091 | 0.997 | 463 | 0.998 | 469 | 0.235 | 2109 | 0.342 | 2382 | 0.406 | 67 | 0.424 | 4277 | 0.998 | 12 | 5.363 | 0 | 5.363 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26555 | A26555T|(membrane_glycoprotein:A33T(E11D)) | 1716 | 0.087 | 574 | 0.029 | 1643 | 0.151 | 3088 | 0.999 | 1487 | 0.736 | 3939 | 0.642 | 3281 | 0.555 | 34 | 0.21 | 2079 | 0.999 | 9 | 4.408 | 0 | 4.408 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26568 | C26568A|(membrane_glycoprotein:C46A(L16I)) | 12252 | 0.671 | 737 | 0.097 | 2335 | 0.296 | 6796 | 0.388 | 8404 | 0.466 | 5161 | 0.284 | 840 | 0.274 | 824 | 0.228 | 4557 | 0.479 | 1101 | 0.998 | 3218 | 0.999 | 205 | 0.218 | 479 | 1 | 2045 | 0.998 | 5325 | 0.995 | 4973 | 0.997 | 98 | 0.641 | 2379 | 0.995 | 4603 | 0.998 | 19 | 12.022 | 0 | 12.022 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26579 | A26579C|(membrane_glycoprotein:A57C(Q19H)) | 885 | 0.565 | 986 | 0.561 | 3782 | 0.999 | 2613 | 0.357 | 3019 | 0.181 | 3777 | 0.222 | 9229 | 0.541 | 795 | 0.133 | 8 | 3.559 | 0 | 3.559 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26678 | T26678C|(membrane_glycoprotein:T156C(I52I)) | 3302 | 0.075 | 6126 | 0.244 | 4189 | 0.105 | 8951 | 0.219 | 8317 | 0.499 | 15231 | 0.55 | 9594 | 0.388 | 6778 | 0.301 | 22494 | 0.508 | 9 | 2.889 | 0 | 2.889 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26885 | C26885T|(membrane_glycoprotein:C363T(N121N)) | 19651 | 0.236 | 2454 | 0.092 | 2888 | 0.057 | 2753 | 0.17 | 1619 | 0.063 | 6672 | 0.147 | 4131 | 0.098 | 9334 | 0.514 | 8420 | 0.295 | 6562 | 0.27 | 7211 | 0.136 | 11625 | 0.997 | 14678 | 0.507 | 81 | 0.007 | 14 | 3.582 | 0.007 | 3.589 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26897 | T26897G|(membrane_glycoprotein:T375G(H125Q)) | 8200 | 0.263 | 19580 | 0.255 | 139 | 0.009 | 184 | 0.006 | 12024 | 0.44 | 7363 | 0.182 | 17002 | 0.308 | 121 | 0.004 | 142 | 0.007 | 6225 | 0.155 | 33509 | 0.685 | 5440 | 0.22 | 192 | 0.011 | 7789 | 0.179 | 13790 | 0.356 | 8871 | 0.518 | 14708 | 0.568 | 179 | 0.01 | 130 | 0.956 | 15771 | 0.582 | 11509 | 0.527 | 28963 | 0.569 | 14160 | 0.506 | 5 | 0.011 | 24 | 7.316 | 0.011 | 7.327 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27289 | G27289C|(ORF6_protein:GAT88-90CAA(D30Q)) | 734 | 0.088 | 4361 | 0.394 | 357 | 0.266 | 1593 | 0.173 | 914 | 0.164 | 820 | 0.093 | 2326 | 0.258 | 3625 | 0.451 | 404 | 0.118 | 2438 | 0.127 | 3614 | 0.405 | 4196 | 0.219 | 7776 | 0.415 | 241 | 0.126 | 2836 | 0.99 | 4141 | 0.271 | 2073 | 0.183 | 10099 | 0.993 | 6399 | 0.658 | 20154 | 0.991 | 2802 | 0.174 | 6114 | 0.996 | 27087 | 0.994 | 23 | 9.547 | 0 | 9.547 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27291 | T27291A|(ORF6_protein:GAT88-90CAA(D30Q)) | 734 | 0.087 | 4361 | 0.394 | 357 | 0.264 | 1593 | 0.172 | 914 | 0.163 | 820 | 0.093 | 2326 | 0.258 | 3625 | 0.452 | 404 | 0.118 | 2438 | 0.126 | 3614 | 0.404 | 4196 | 0.217 | 7776 | 0.413 | 241 | 0.126 | 2836 | 0.99 | 4141 | 0.27 | 2073 | 0.181 | 10099 | 0.993 | 6399 | 0.657 | 20154 | 0.991 | 2802 | 0.172 | 6114 | 0.996 | 27087 | 0.994 | 23 | 9.531 | 0 | 9.531 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27634 | T27634C|(ORF7a_protein:T241C(S81P)) | 37 | 0.076 | 762 | 0.473 | 452 | 0.169 | 333 | 0.61 | 248 | 0.102 | 230 | 0.087 | 432 | 0.238 | 1100 | 0.508 | 1359 | 0.453 | 81 | 0.106 | 27 | 0.037 | 1301 | 0.446 | 127 | 0.129 | 241 | 0.45 | 147 | 0.305 | 78 | 0.796 | 120 | 0.952 | 295 | 0.886 | 33 | 1 | 517 | 0.992 | 20 | 8.815 | 0 | 8.815 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27692 | 27692-insertTCTCAATTAGAT|(ORF7a_protein:ATT298-300ATCTCAATTAGATTTinsert(I100ISIRF)) | 59 | 0.089 | 669 | 0.348 | 669 | 0.212 | 392 | 0.531 | 285 | 0.707 | 356 | 0.137 | 1044 | 0.376 | 712 | 0.323 | 1502 | 0.564 | 1174 | 0.334 | 198 | 0.244 | 15 | 0.019 | 892 | 0.252 | 120 | 0.1 | 227 | 0.37 | 113 | 0.238 | 40 | 0.364 | 45 | 0.331 | 195 | 0.459 | 22 | 0.647 | 162 | 0.256 | 21 | 6.901 | 0 | 6.901 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27795 | T27795A|(ORF7b:T40A(L14I)) | 10252 | 0.414 | 5130 | 0.415 | 22111 | 0.964 | 16306 | 0.561 | 11573 | 0.348 | 10717 | 0.996 | 6928 | 0.265 | 19168 | 0.496 | 16814 | 0.435 | 27552 | 0.873 | 1742 | 0.099 | 2204 | 0.252 | 69 | 0.004 | 6917 | 0.179 | 10811 | 0.488 | 239 | 0.013 | 1299 | 0.5 | 9104 | 0.219 | 27030 | 0.83 | 6681 | 0.691 | 467 | 0.106 | 3060 | 0.181 | 15648 | 0.622 | 2127 | 0.265 | 72 | 0.742 | 17261 | 0.991 | 9614 | 0.949 | 8458 | 0.993 | 7451 | 0.516 | 9678 | 0.976 | 28544 | 0.996 | 4 | 0.001 | 32 | 16.379 | 0.001 | 16.38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28152 | AC28152-28153del|(ORF8_protein:259-260del(87fs)) | 2251 | 0.52 | 2380 | 0.409 | 20643 | 0.667 | 12632 | 0.41 | 7388 | 0.538 | 4239 | 0.477 | 7248 | 0.319 | 5906 | 0.268 | 6458 | 0.357 | 12548 | 0.898 | 6498 | 0.422 | 723 | 0.149 | 76 | 0.012 | 1868 | 0.243 | 4020 | 0.39 | 1667 | 0.268 | 3277 | 0.18 | 3388 | 0.27 | 2330 | 0.996 | 6261 | 0.627 | 198 | 0.102 | 2543 | 0.449 | 4769 | 0.997 | 7886 | 0.851 | 13309 | 0.997 | 4272 | 0.926 | 109 | 1 | 3852 | 0.426 | 6425 | 0.998 | 29 | 15.166 | 0 | 15.166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28271 | A28271G | 9197 | 0.325 | 7775 | 0.394 | 41588 | 0.657 | 38391 | 0.432 | 17708 | 0.484 | 7511 | 0.192 | 14300 | 0.231 | 22079 | 0.267 | 18695 | 0.314 | 18571 | 0.328 | 34101 | 0.858 | 7276 | 0.202 | 4283 | 0.26 | 2063 | 0.075 | 9100 | 0.238 | 13967 | 0.466 | 2091 | 0.06 | 4113 | 0.121 | 9733 | 0.298 | 22686 | 0.714 | 12892 | 0.622 | 529 | 0.078 | 3422 | 0.161 | 10008 | 0.42 | 4621 | 0.999 | 1857 | 0.345 | 13668 | 0.899 | 26973 | 0.999 | 12942 | 0.893 | 4378 | 0.998 | 14663 | 0.709 | 8441 | 0.403 | 21999 | 0.999 | 33 | 15.441 | 0 | 15.441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28321 | G28321A|(nucleocapsid_phosphoprotein:G48A(T16T)) | 8274 | 0.211 | 1756 | 0.093 | 2535 | 0.082 | 6414 | 0.153 | 3755 | 0.111 | 4753 | 0.119 | 9536 | 0.295 | 21991 | 0.688 | 13904 | 0.61 | 4460 | 0.19 | 10982 | 0.424 | 6644 | 0.998 | 1777 | 0.32 | 14540 | 0.884 | 27202 | 0.85 | 11622 | 0.741 | 3377 | 0.879 | 12543 | 0.678 | 9787 | 0.398 | 22672 | 0.922 | 20 | 9.646 | 0 | 9.646 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28382 | RATG13 | T28382C|(nucleocapsid_phosphoprotein:T109C(S37P)) | 7152 | 0.319 | 5994 | 0.394 | 28463 | 0.685 | 24917 | 0.476 | 10537 | 0.459 | 6757 | 0.181 | 10522 | 0.226 | 14071 | 0.26 | 11803 | 0.28 | 10956 | 0.327 | 27582 | 0.87 | 3302 | 0.137 | 3296 | 0.26 | 2029 | 0.093 | 7392 | 0.256 | 11471 | 0.483 | 736 | 0.024 | 1523 | 0.068 | 5736 | 0.286 | 19346 | 0.701 | 9135 | 0.63 | 436 | 0.089 | 3802 | 0.185 | 8248 | 0.433 | 3483 | 0.998 | 1637 | 0.357 | 9621 | 0.927 | 19888 | 0.93 | 10124 | 0.907 | 3466 | 0.998 | 12265 | 0.706 | 6178 | 0.394 | 17612 | 0.999 | 33 | 15.338 | 0 | 15.338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ubiq | 28881 | G28881A|(nucleocapsid_phosphoprotein:AGG607-609AAA(R203K)) | 14511 | 0.999 | 9931 | 0.997 | 26670 | 0.998 | 4894 | 0.999 | 20841 | 0.887 | 13735 | 0.998 | 8443 | 0.999 | 9292 | 0.998 | 22392 | 0.998 | 9595 | 0.997 | 13888 | 0.998 | 16795 | 0.998 | 14429 | 0.998 | 11268 | 0.997 | 12403 | 0.998 | 18020 | 0.997 | 16007 | 0.989 | 9458 | 0.993 | 17964 | 0.997 | 418 | 0.963 | 5363 | 0.992 | 18683 | 0.999 | 18229 | 0.994 | 14574 | 0.994 | 3128 | 0.992 | 1648 | 0.991 | 1748 | 0.997 | 8628 | 0.992 | 7386 | 0.992 | 5883 | 0.995 | 3222 | 0.998 | 5596 | 0.994 | 10969 | 0.893 | 9221 | 0.994 | 6832 | 0.992 | 3658 | 0.993 | 20133 | 0.997 | 21200 | 0.998 | 15507 | 0.998 | 3374 | 0.997 | 12369 | 0.998 | 11612 | 0.965 | 49152 | 0.998 | 16522 | 0.997 | 12223 | 0.998 | 13226 | 0.998 | 8122 | 0.999 | 1430 | 0.997 | 2261 | 0.998 | 787 | 1 | 12573 | 0.174 | 627 | 0.957 | 5011 | 0.998 | 19284 | 0.585 | 3450 | 0.995 | 10679 | 0.998 | 24240 | 0.989 | 16314 | 0.992 | 3961 | 0.997 | 13478 | 0.993 | 1545 | 0.995 | 2398 | 0.995 | 1258 | 0.998 | 3964 | 0.998 | 8565 | 0.996 | 489 | 0.994 | 615 | 0.995 | 5513 | 0.997 | 10179 | 0.992 | 12057 | 0.993 | 8876 | 0.997 | 15233 | 0.997 | 72 | 37.595 | 32.568 | 70.163 | ||||||||||||
ubiq | 28882 | G28882A|(nucleocapsid_phosphoprotein:AGG607-609AAA(R203K)) | 14511 | 0.999 | 9931 | 0.997 | 26670 | 0.998 | 4894 | 0.999 | 20841 | 0.888 | 13735 | 0.998 | 8443 | 0.999 | 9292 | 0.998 | 22392 | 0.998 | 9595 | 0.997 | 13888 | 0.998 | 16795 | 0.998 | 14429 | 0.998 | 11268 | 0.997 | 12403 | 0.998 | 18020 | 0.997 | 16007 | 0.989 | 9458 | 0.993 | 17964 | 0.997 | 418 | 0.963 | 5363 | 0.992 | 18683 | 0.999 | 18229 | 0.994 | 14574 | 0.994 | 3128 | 0.992 | 1648 | 0.991 | 1748 | 0.996 | 8628 | 0.992 | 7386 | 0.992 | 5883 | 0.995 | 3222 | 0.998 | 5596 | 0.994 | 10969 | 0.981 | 9221 | 0.994 | 6832 | 0.992 | 3658 | 0.993 | 20133 | 0.997 | 21200 | 0.998 | 15507 | 0.998 | 3374 | 0.997 | 12369 | 0.998 | 11612 | 0.965 | 49152 | 0.998 | 16522 | 0.997 | 12223 | 0.998 | 13226 | 0.998 | 8122 | 0.999 | 1430 | 0.997 | 2261 | 0.998 | 787 | 1 | 12573 | 0.176 | 627 | 0.957 | 5011 | 0.998 | 19284 | 0.586 | 3450 | 0.995 | 10679 | 0.998 | 24240 | 0.989 | 16314 | 0.992 | 3961 | 0.997 | 13478 | 0.993 | 1545 | 0.995 | 2398 | 0.995 | 1258 | 0.998 | 3964 | 0.998 | 8565 | 0.996 | 489 | 0.994 | 615 | 0.995 | 5513 | 0.997 | 10179 | 0.992 | 12057 | 0.993 | 8876 | 0.997 | 15233 | 0.997 | 72 | 37.683 | 32.571 | 70.2539999999999 | ||||||||||||
ubiq | 28883 | G28883C|(nucleocapsid_phosphoprotein:G610C(G204R)) | 14520 | 1 | 9950 | 0.999 | 26693 | 0.999 | 4896 | 0.999 | 23454 | 0.999 | 13752 | 0.999 | 8443 | 0.999 | 9302 | 0.999 | 22413 | 0.998 | 9606 | 0.998 | 13897 | 0.999 | 16614 | 0.987 | 14436 | 0.999 | 11291 | 0.999 | 12411 | 0.998 | 18047 | 0.999 | 16145 | 0.998 | 9505 | 0.998 | 18001 | 0.999 | 428 | 0.986 | 5404 | 1 | 18699 | 0.999 | 18279 | 0.997 | 13944 | 0.951 | 3148 | 0.998 | 1660 | 0.998 | 1751 | 0.998 | 8686 | 0.999 | 7421 | 0.997 | 5905 | 0.999 | 3226 | 0.999 | 5618 | 0.998 | 11157 | 0.997 | 9223 | 0.995 | 6841 | 0.993 | 3680 | 0.999 | 20164 | 0.999 | 21213 | 0.999 | 15524 | 0.999 | 3380 | 0.999 | 12384 | 0.999 | 11633 | 0.967 | 49193 | 0.999 | 16552 | 0.999 | 12239 | 1 | 13236 | 0.999 | 8124 | 0.999 | 1433 | 0.999 | 2263 | 0.999 | 785 | 0.997 | 12615 | 0.177 | 649 | 0.991 | 5020 | 0.999 | 19416 | 0.591 | 3466 | 1 | 10689 | 0.999 | 24439 | 0.997 | 16424 | 0.998 | 3970 | 1 | 13540 | 0.998 | 1552 | 0.999 | 2407 | 0.999 | 1260 | 0.999 | 3963 | 0.998 | 8584 | 0.998 | 492 | 1 | 617 | 0.998 | 5520 | 0.999 | 10244 | 0.998 | 12116 | 0.998 | 8893 | 0.999 | 15142 | 0.991 | 72 | 37.866 | 32.681 | 70.547 | ||||||||||||
29167 | C29167T|(nucleocapsid_phosphoprotein:C894T(Y298Y)) | 383 | 0.032 | 5467 | 0.263 | 7 | 0.001 | 739 | 0.07 | 5169 | 0.249 | 491 | 0.047 | 1943 | 0.113 | 620 | 0.055 | 1803 | 0.098 | 4638 | 0.795 | 3251 | 0.499 | 3861 | 0.286 | 5902 | 0.413 | 1972 | 0.262 | 23 | 0.002 | 9279 | 0.389 | 16 | 3.574 | 0 | 3.574 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29445 | C29445T|(nucleocapsid_phosphoprotein:C1172T(T391I)) | 3822 | 0.169 | 2703 | 0.221 | 4195 | 0.268 | 5022 | 0.376 | 6084 | 0.995 | 8206 | 0.996 | 4662 | 0.383 | 3010 | 0.995 | 1066 | 0.495 | 5787 | 0.995 | 9578 | 0.995 | 8648 | 0.966 | 1160 | 0.992 | 9596 | 0.998 | 14 | 9.844 | 0 | 9.844 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29464 | T29464A|(nucleocapsid_phosphoprotein:T1191A(A397A)) | 794 | 0.125 | 5194 | 0.296 | 25417 | 0.725 | 8417 | 0.472 | 1325 | 0.275 | 3817 | 0.51 | 12207 | 0.471 | 3730 | 0.215 | 6333 | 0.519 | 14410 | 0.833 | 3399 | 0.17 | 1142 | 0.12 | 2513 | 0.225 | 4176 | 0.47 | 7211 | 0.48 | 1245 | 0.294 | 4662 | 0.387 | 5707 | 0.791 | 7605 | 0.978 | 4215 | 0.377 | 2835 | 0.955 | 878 | 0.445 | 5525 | 0.981 | 9175 | 0.966 | 7950 | 0.916 | 1050 | 0.962 | 9169 | 0.964 | 27 | 14.922 | 0 | 14.922 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29576 | TTC29576-29578del|(ORF10_protein:19-21del(F7del)) | 5030 | 0.258 | 2532 | 0.953 | 1362 | 0.067 | 2970 | 0.244 | 19 | 0.005 | 2139 | 0.721 | 3163 | 0.382 | 3026 | 0.243 | 44 | 0.089 | 871 | 0.186 | 10 | 3.148 | 0 | 3.148 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29580 | CTTT29580-29583del|(ORF10_protein:GCTTTT22-27GG(AF8-9fs)) | 5029 | 0.26 | 2530 | 0.952 | 1362 | 0.068 | 2970 | 0.248 | 19 | 0.005 | 2137 | 0.723 | 3403 | 0.415 | 3027 | 0.246 | 44 | 0.09 | 869 | 0.189 | 10 | 3.19599999999999 | 0 | 3.19599999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29584 | T29584G|(ORF10_protein:GCTTTT22-27GG(AF8-9fs)) | 5029 | 0.26 | 2530 | 0.952 | 1362 | 0.068 | 2970 | 0.248 | 19 | 0.005 | 2137 | 0.723 | 3403 | 0.415 | 3027 | 0.246 | 44 | 0.09 | 869 | 0.189 | 10 | 3.19599999999999 | 0 | 3.19599999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29586 | C29586A|(ORF10_protein:C29A(P10Q)) | 5258 | 0.272 | 4 | 0.004 | 2654 | 0.998 | 1447 | 0.073 | 3128 | 0.26 | 2 | 0.001 | 24 | 0.007 | 2267 | 0.766 | 3539 | 0.432 | 3179 | 0.258 | 48 | 0.099 | 894 | 0.194 | 8 | 0.003 | 21 | 0.001 | 3 | 0.001 | 3 | 0.001 | 2 | 0.003 | 17 | 3.364 | 0.009 | 3.37299999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29588 | T29588A|(ORF10_protein:T31A(F11I)) | 5257 | 0.271 | 2651 | 0.997 | 1445 | 0.072 | 2 | 0.001 | 3125 | 0.26 | 21 | 0.006 | 2259 | 0.762 | 3530 | 0.431 | 3185 | 0.258 | 48 | 0.098 | 895 | 0.194 | 10 | 0.004 | 25 | 0.001 | 4 | 0.001 | 5 | 0.001 | 15 | 3.35 | 0.007 | 3.357 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29708 | C29708T | 767 | 0.075 | 1117 | 0.139 | 3213 | 0.328 | 1945 | 0.103 | 439 | 0.057 | 422 | 0.075 | 209 | 0.082 | 869 | 0.099 | 8091 | 0.393 | 4206 | 0.998 | 2440 | 0.127 | 302 | 0.603 | 4439 | 0.36 | 33 | 0.01 | 3602 | 0.828 | 4082 | 0.416 | 1192 | 0.087 | 87 | 0.174 | 1894 | 0.355 | 19 | 5.309 | 0 | 5.309 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29734 | GAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGT29734-29758del | 426 | 0.068 | 1857 | 0.301 | 1096 | 0.077 | 236 | 0.045 | 114 | 0.066 | 146 | 0.019 | 4334 | 0.343 | 2564 | 1 | 1361 | 0.084 | 154 | 0.435 | 2609 | 0.378 | 20 | 0.01 | 2310 | 0.736 | 2311 | 0.282 | 680 | 0.048 | 48 | 0.105 | 1186 | 0.263 | 17 | 4.26 | 0 | 4.26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29758 | RATG13 | T29758G | 1695 | 0.256 | 5519 | 0.739 | 340 | 0.05 | 9225 | 0.585 | 1880 | 0.34 | 2730 | 0.685 | 1435 | 0.337 | 760 | 0.188 | 443 | 0.248 | 7098 | 0.825 | 3025 | 0.589 | 1040 | 0.224 | 1358 | 0.443 | 1008 | 0.105 | 4286 | 0.329 | 3950 | 0.41 | 14701 | 0.797 | 654 | 0.51 | 2574 | 0.364 | 1808 | 0.999 | 869 | 0.272 | 6262 | 0.687 | 14214 | 0.921 | 448 | 0.898 | 1308 | 0.559 | 4055 | 0.772 | 26 | 13.132 | 0 | 13.132 |